基于残余杂合系的水稻显性矮秆基因的定位及KASP标记开发

刘开强; 崔中秋; 李军玲; 孙玥; 苏京平; 王胜军; 高菊; 张嘉楠; 闫双勇; 《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：株高是和水稻高产、稳产密切相关的重要农艺性状,发掘可育种利用的矮秆基因有重要的应用价值.本研究利用育种残余杂合系,鉴定了一个显性矮秆基因sd9,该基因能将株高降低18 cm.近等基因系F2群体的遗传学分析显示矮秆植株与高秆植株的分离比为3∶1,表明sd9为显性矮秆基因.构建了极高单株和极矮单株两个极端表型DNA混合池.利用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)和40 k水稻SNP检测液相芯片相结合的方法进行了DNA混合池的基因型鉴定,将sd9基因定位于第9染色体14 976 197~14 993 586 bp区间.根据该区间的SNP开发了sd9连锁的KASP标记,验证了定位结果.分子标记的单因素方差分析显示:区间内的分子标记和株高极显著相关.单个标记QTL检测LOD值为57.50,解释表型效应66.50%.利用育种残余杂合系鉴定的sd9及其KASP标记的开发,可以为水稻株型的分子育种提供可直接利用的基因资源.

关键词： 水稻 显性矮秆基因 育种残余杂合系 定位 靶向测序基因型检测