基于SNP标记的爆裂玉米农家品种遗传多样性

曾艳华; 谢和霞; 江禹奉; 周锦国; 谢小东; 周海宇; 谭贤杰; 覃兰秋; 程伟东; 《作物杂志 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：为了评价广西爆裂玉米农家品种的遗传多样性,利用56K SNP芯片技术对中国广西45个爆裂玉米农家品种、中国2个爆裂玉米杂交种和6个南美爆裂玉米种质进行全基因组扫描,获得多态性标记14 338个,基因分型为6种类型.其中A/G类型最多,为5 805个;A/T类型最少,为149个.1号染色体的多态性SNP位点最多,为2 302个;10号染色体最少,为848个.45个农家品种间平均遗传相似系数为0.62,变幅为0.41~0.99,总体遗传相似度高.聚类分析将参试品种划分为三大类群,相同来源的农家品种大多聚在一起;主成分分析显示大部分农家品种聚在一起,与杂交品种和南美品种之间没有交集,表明农家品种遗传相似性较高,与杂交品种和南美品种遗传差异较大.

关键词： 爆裂玉米 种质资源 农家品种 SNP基因芯片 DNA分型