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基于SNP标记的爆裂玉米农家品种遗传多样性

文献类型: 中文期刊

作者: 曾艳华 1 ; 谢和霞 1 ; 江禹奉 1 ; 周锦国 1 ; 谢小东 1 ; 周海宇 1 ; 谭贤杰 1 ; 覃兰秋 1 ; 程伟东 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区农业科学院玉米研究所/国家玉米改良中心广西分中心

关键词: 爆裂玉米;种质资源;农家品种;SNP基因芯片;DNA分型

期刊名称: 作物杂志

ISSN: 1001-7283

年卷期: 2020 年 005 期

页码: 65-70

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了评价广西爆裂玉米农家品种的遗传多样性,利用56K SNP芯片技术对中国广西45个爆裂玉米农家品种、中国2个爆裂玉米杂交种和6个南美爆裂玉米种质进行全基因组扫描,获得多态性标记14 338个,基因分型为6种类型.其中A/G类型最多,为5 805个;A/T类型最少,为149个.1号染色体的多态性SNP位点最多,为2 302个;10号染色体最少,为848个.45个农家品种间平均遗传相似系数为0.62,变幅为0.41~0.99,总体遗传相似度高.聚类分析将参试品种划分为三大类群,相同来源的农家品种大多聚在一起;主成分分析显示大部分农家品种聚在一起,与杂交品种和南美品种之间没有交集,表明农家品种遗传相似性较高,与杂交品种和南美品种遗传差异较大.

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