水稻糯性相关基因的全基因组关联分析

农保选; 夏秀忠; 张宗琼; 曾宇; 刘开强; 邓国富; 李丹婷; 《植物学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：利用1 090 071个SNP标记,对419份广西地方稻种资源核心种质的糯性进行全基因组关联分析。结果表明,运用混合线性模型,在P<4.72×10~(–8)(4.72E–8)水平下,检测到45个与糯性显著关联的SNP位点,均位于第6号染色体上。通过筛选显著关联位点上、下游各150 kb区域内的基因,共找到305个候选基因,其中包含2个与淀粉合成酶相关的Wx和SSIIa基因;同时在第6号染色体5.69–5.89 Mb区域发现4个与糯性显著关联的SNP位点,该区域可能是影响水稻(Oryza sativa)糯性的重要候选区域。

关键词： 水稻 全基因组关联分析 糯性 候选基因