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水稻糯性相关基因的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 农保选 1 ; 夏秀忠 1 ; 张宗琼 1 ; 曾宇 1 ; 刘开强 2 ; 邓国富 2 ; 李丹婷 1 ;

作者机构： 1.广西农业科学院水稻研究所

2.广西农业科学院

关键词： 水稻;全基因组关联分析;糯性;候选基因

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2016 年 51 卷 06 期

页码： 737-742

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用1 090 071个SNP标记,对419份广西地方稻种资源核心种质的糯性进行全基因组关联分析。结果表明,运用混合线性模型,在P<4.72×10~(–8)(4.72E–8)水平下,检测到45个与糯性显著关联的SNP位点,均位于第6号染色体上。通过筛选显著关联位点上、下游各150 kb区域内的基因,共找到305个候选基因,其中包含2个与淀粉合成酶相关的Wx和SSIIa基因;同时在第6号染色体5.69–5.89 Mb区域发现4个与糯性显著关联的SNP位点,该区域可能是影响水稻(Oryza sativa)糯性的重要候选区域。

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