科研产出
火龙果溃疡病对果皮组织微生物群落特征的影响
《热带作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:水果果皮组织的微生物群落有助于提高水果品质和抗病性,但关于火龙果果皮内生微生物的群落结构和多样性的研究报道比较缺乏.本研究采用 Illumina MiSeq 高通量测序技术分析火龙果健康幼果与溃疡病发生初期的罹病果果皮组织内生微生物群落组成及多样性,并预测其群落功能,以了解溃疡病发生初期火龙果果皮内生微生物群落特征.结果表明:在火龙果青果期,健康果和罹病果果皮之间的内生细菌和真菌群落多样性和群落结构差异不显著.健康果果皮的内生微生物中,优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)、异球菌门(Deinococcota)、脱硫杆菌门(Desulfobacterota)和绿弯菌门(Chloroflexi),优势真菌门为子囊菌门(Ascomycota)、真菌未鉴定门(unclassified_k__Fungi)、担子菌门(Basidiomycota)和毛霉门(Mucoromycota).溃疡病发生初期,变形菌门、放线菌门和异球菌门的细菌和子囊菌门的真菌的平均相对丰度显著下降,脱硫杆菌门的细菌和真菌未鉴定门的真菌的平均相对丰度显著上升.随着菌群比例变化,罹病果皮内生细菌的化学异养、需氧化学异养、甲基营养以及甲醇氧化功能的表达量显著下降,内生细菌的潜在致病性类群比例显著提高,内生真菌的腐生营养型、病理营养型和病理-共生营养型的比例显著下降,未知营养型的内生真菌比例显著上升.研究结果提供了火龙果果皮内生微生物的生物信息,为揭示火龙果内生微生物在溃疡病发生中的作用以及利用内生有益微生物功能提供理论依据.
关键词: 火龙果 溃疡病 果皮组织 内生细菌 内生真菌 群落多样性
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广西沃柑根系内生真菌的多样性分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:【目的】探究清耕和生草措施对沃柑根系内生真菌多样性的影响,为筛选和开发促生、防病和抗逆等功能的有益内生真菌资源提供科学依据。【方法】选取广西南宁市武鸣区6个代表性沃柑果园(生草模式和清耕模式各3个),调查其土壤养分水平,利用高通量测序技术对沃柑根系内生真菌ITS区进行测定,分析沃柑根系样品中真菌群落的多样性及其分布规律。【结果】广西南宁市武鸣区沃柑果园的土壤为酸性,速效钾、有机质含量丰富。从沃柑果树根系样品中共检测出内生真菌12门42纲102目224科416属,其中真菌在门分类水平上的主要优势类群是子囊菌门(Ascomycota),在属分类水平上的主要优势类群为新赤壳属(Neocosmospora)和青霉属(Penicillium),自然生草及清耕模式下的沃柑根系内生真菌群落结构无明显差异。典型相关分析(CCA)结果表明,沃柑果园根系真菌群落与硝态氮、铵态氮、土壤有机质呈极显著相关(P<0.01),与pH呈显著相关(P<0.05),与速效磷、速效钾无显著相关性(P>0.05)。所有试验果园根系中的营养功能类群结构均相似,以腐生—营养型内生真菌菌群的相对丰度最高,其次为未鉴定的功能群、病理—腐生—共生营养型,其他营养功能类群在不同果园中占比均较低。【结论】广西沃柑根系内生真菌以新赤壳属和青霉属为优势属,该区域尺度下的沃柑根系内生真菌群落组成与生草管理无显著相关,但受部分土壤环境因子调控。
关键词: 沃柑 植物内生真菌 群落多样性 FUNGuild 广西
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