科研产出
食用木薯桂木薯11号自交分离群体表型鉴定与遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:构建自交分离群体是木薯新品种选育的重要途径之一。对食用木薯桂木薯11号品种自交分离群体的99份资源进行表型性状鉴定,利用变异系数、遗传多样性指数、相关性与主成分分析、SSR分子标记、聚类分析等进行遗传多样性分析,并筛选优异种质。结果表明,食用木薯品种桂木薯11号自交分离群体的99份资源在43个性状指标上表现出差异。33个质量性状在不同类型上均有分布,各类型分布频率分布范围为1.01%~98.99%,其中不结实性的分布频率最高;遗传多样性指数范围为0.06~1.59,其中分叉级别遗传多样性指数最高,结实性最低。10个数量性状变异系数范围为13.49%~62.30%,其中分叉高度变异系数最高,节间距最低;遗传多样性指数范围为1.78~2.09,其中裂叶长度最高,主茎分枝角度最低。主成分分析共提取到15个主成分,主茎内皮颜色、幼茎颜色、叶脉颜色、顶端叶颜色等27个表型性状可作为该自交分离群体鉴定的主要指标。SSR分子标记遗传多样性分析表明,24对引物共扩增出148条条带,多态性比例达83.56%。桂木薯11号品种自交分离群体资源间遗传相似系数范围为0.48~0.91,其中94号与亲本桂木薯11号遗传相似系数最高,为0.78;143号最低,为0.59。本研究通过对桂木薯11号品种自交分离群体的鉴定评价,筛选出一批特异性种质和中间材料,丰富了我国木薯种质资源遗传多样性,为食用型木薯新品种选育提供了研究基础。
关键词: 桂木薯11号 自交分离群体 表型鉴定 遗传多样性分析
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木薯'新选048'自交系群体表型鉴定评价及遗传多样性分析
《植物生理学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:为了研究木薯'新选048'自交系群体的遗传差异,本研究通过变异系数、遗传多样性指数、多态性比例、遗传相似系数、聚类分析等方面对'新选048'的83个自交系株系进行表型鉴定及遗传多样性分析.结果表明,自交系株系各性状的变异系数处于9.94%~157.74%之间,数量性状的变异系数低于质量性状,叶长最低,茎分叉习性最高;遗传多样性指数处于0.07~1.91之间,数量性状的遗传多样性指数高于质量性状,叶尖形状和顶端叶颜色最低,最大薯长最高.块根中氢氰酸(HCN)、淀粉和可溶性总糖含量均发生分离.与亲本相比,各株系的淀粉含量均低,可溶性总糖含量均高,且分离出低HCN株系.相关性分析表明,极显著相关的性状有26对,显著相关的性状有16对.24个表型性状共提取了9个主成分, 21个性状起主要作用.利用SSR分子标记进行遗传多样性分析, 18对引物共扩增出78条条带,多态性比例达89.74%,各株系间遗传相似系数介于0.40~0.90之间.对比表型聚类和分子标记聚类结果,发现二者具有一定的关联性,但不完全相同,聚类结果并无明显规律.本研究通过自交系鉴定出一批木薯中间材料,丰富了我国木薯种质资源的遗传多样性,并为木薯自交系育种提供参考.
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广西地方葛根种质资源遗传多样性的SCoT分析
《核农学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:为了解广西地方葛根种质资源之间的亲缘关系,本研究以SCoT分子标记对44份广西葛根种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,并进行遗传多样性分析。结果表明,25条SCoT引物共扩增出223个条带,其中具有多态性的条带有194条,平均每条引物获得7.76个多态性条带,多态性比例为86.99%。聚类分析表明,44份葛根种质资源的遗传相似系数在0.587~0.982之间。在系数0.65处,44份葛根分为两大类,37号材料单独成为一类;在系数为0.74处,可聚为六类。综上所述,SCoT分子标记适用于葛根种质资源遗传多样性分析,本研究结果为广西葛根种质资源鉴定评价和新品种选育奠定了一定的理论基础。
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广西莪术EST-SSR标记开发及其在遗传多样性分析中的应用
《药物分析杂志 》 2017 北大核心 CSCD
摘要:目的:分析姜黄表达序列标签(EST)中简单重复序列(SSR)位点的分布特点,开发近缘种广西莪术EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于进行广西莪术遗传多样性分析及分子育种的可行性。方法:下载NCBI中公布的姜黄EST 12 678条,利用SSR-FINDER搜索SSR位点,筛选符合条件的序列,采用Primer 5.0设计SSR引物,挑选30个表现型差异较大的广西莪术种质进行引物有效性及多态性检测,对50份广西莪术种质进行遗传多样性分析。结果:12 678条EST序列含有SSR位点1 243个,其中二核苷酸出现频率为50.36%,三核苷酸31.54%,四核苷酸10.30%,以AT/TA和CT/GA出现频率最高。利用Primer 5.0设计引物共325对,聚合酶链式反应(PCR)检测表明,104对引物可以扩增出理想PCR产物,在至少30份不同种质广西莪术中检测到48对SSR引物具有多态性,占设计引物的38.09%。遗传多样性分析研究,聚类分析结果表明50份广西莪术种质在相关系数0.7处,聚类为2类,遗传相似性系数变化范围较窄。结论:姜黄EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究开发了48对广西莪术EST-SSR标记,并筛选出富含SSR位点的候选序列,用聚类图验证了植物之间的亲缘关系,为广西莪术遗传多样性分析和分子育种研究提供参考。
关键词: 广西莪术 姜黄 表达序列标签-简单重复序列 引物开发 特异引物标记技术 分子标记体系 微卫星序列 遗传多样性分析
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