地芽孢杆菌Geobacillus sp.GXS1α-淀粉酶的饱和突变及酶学性质研究

裴建新; 王治宾; 罗章; 韦宇拓; 《生物技术通报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要：采用半理性设计方法,在网站Geno3D上以PDB数据库中B.stearothermophilus麦芽糖淀粉酶(BSMA)的三维结构为模板,对AMY(α-淀粉酶)进行三维结构同源建模(二者氨基酸的同源性为33%)。比较同源建模预测的3D结构和模板BSMA的3D结构关键位点,在此基础上通过计算机辅助设计软件ProSa2003,根据能量变化确定了AMY三个饱和突变位点:D192、E221和D289。利用兼并引物对AMY的假定活性中心位点D192、E221和D289的氨基酸分别进行饱和突变,定点(饱和)突变库筛选得到4个有活力的突变子D192A、E221N、E221L和D289L,并对突变酶的酶学性质进行初步研究。

关键词： 地芽孢杆菌 α-淀粉酶 酶学性质 饱和突变