果蔗拔地拉及其芽变株系的SCoT、BPS和URP联合分子鉴定

熊发前; 刘欣; 刘丽敏; 罗丽; 《基因组学与应用生物学 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：前期我们获得了果蔗拔地拉的4份自然芽变株系,本研究旨在揭示果蔗拔地拉及其自然芽变株系在DNA水平上的分子差异。综合采用基于单引物扩增反应的三种分子标记技术(SCoT,BPS和URP)的20条单引物对果蔗拔地拉及其自然芽变株系进行分子鉴定。结果表明:(1)在随机使用的20条单引物(3条SCoT标记单引物,5条BPS标记单引物和12条URP标记单引物)中,BPS9、URP6R和URP17R这三条单引物均扩增失败,未能扩增出任何条带,剩下的17条单引物总共扩增产生了89条条带,17条单引物中平均每条单引物扩增出5.24条条带;(2)3条SCoT标记单引物和5条BPS标记单引物均未能扩增产生出明显的可重复差异条带,只有URP标记单引物URP38F能扩增产生一条由亮度强弱及有/无同时存在引起的可重复差异条带,该条带大小约625 bp,该条单引物及其所产生的约625 bp大小的条带可用于果蔗拔地拉及其自然芽变株系的分子鉴定,能有效区分果蔗拔地拉及其自然芽变株系在DNA分子水平上显示出来的微小的遗传差异。

关键词： 甘蔗 果蔗拔地拉 芽变株系 分子鉴定 SCoT BPS URP 分子标记