科研产出
第2年宿根蔗根围土壤丛枝菌根真菌多样性研究
《热带作物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探究不同施肥水平下第2年宿根蔗根围土壤丛枝菌根（arbuscular mycorrhizal, AM）真菌的多样性，为AM真菌在甘蔗上的应用提供理论依据。本研究以甘蔗品种桂糖29号（GT29）和桂糖58号（GT58）为试验材料，设4个施肥水平：0.0 kg/hm2（A）、562.5 kg/hm2（B）、1125.0 kg/hm2（C）、2250.0 kg/hm2（D）。研究结果表明：不同施肥水平对GT29的根系菌根侵染率有显著影响，而对GT58影响不显著。随着施肥水平的提高，AM真菌多样性和丰富度均显著下降。不同施肥水平的GT29根围土壤中共获得185个OTUs,GT58根围土壤中共获得175个OTUs。不同施肥水平下2个甘蔗品种根围土壤的优势AM真菌均为球囊霉属（Glomus）。在OTU水平对不同施肥水平甘蔗根围土壤AM真菌群落进行差异物种分析，发现GT29的2个差异物种均为球囊霉属，而GT58中的3个差异物种均为近明球囊霉属（Claroideoglomus）。经Mantel检验，发现土壤中的Ca、Mg含量与4个AM真菌属之间均呈极显著正相关，土壤pH与3个AM真菌属间也呈显著正相关。因此，过量施肥会使增产效果大幅降低，且造成土壤酸化及磷元素过剩，同时使甘蔗根围土壤AM真菌群落组成改变，多样性和丰富度降低，但品种间有差异；适量施肥有助于丰富土壤AM真菌的多样性，促进甘蔗产业的可持续发展。
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66个广西审定丝苗品种农艺和品质性状多样性鉴定与聚类分析
《中国稻米 》 2024
摘要：为了明确广西审定水稻丝苗品种的农艺和品质性状差异与趋同程度，选用2017—2023年广西审定的66个丝苗品种为材料，对18个主要农艺和品质性状进行鉴定、表型多样性分析和品种间聚类分析。结果表明，这66个品种农艺性状表型和品质性状多样性丰富；基于农艺性状表型和品质性状的品种间欧氏距离聚类，可分为5类，包含29个品种的类群农艺性状表型和品质性状表现趋同，此类群包含两系杂交稻品种、三系杂交稻品种和常规稻品种；两系杂交稻品种表型多样性最高，分布于各个类群中，常规稻最低，基本被聚在同一大类中。类群间农艺性状表型和品质性状差异明显，具有相同母本或相同父本的品种基本聚归同类，品种间欧氏距离短。育种组配间会出现亲缘关系较远、农艺和品质性状接近的趋同情况。结果可为广西丝苗型水稻品种的组配选育和推广应用提供理论支持。
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广西中越边境喀斯特地区大型真菌资源多样性
《菌物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：广西中越边境喀斯特森林属北热带喀斯特季节性雨林，是具有国际意义的陆地生态系统多样性关键地区之一，但目前对该地区大型真菌系统性研究尚不完备。本研究历时7年共采集大型真菌标本1 500余份，通过形态学分类方法与分子生物学手段鉴定物种232种，隶属于2门7纲20目61科135属，其中子囊菌门25种，担子菌门207种，新增广西新记录种30种。含10种以上的优势科有4科，为多孔菌科Polyporaceae、小皮伞科Marasmiaceae、牛肝菌科Boletaceae和蘑菇科Agaricaceae；含5种以上的优势属有6属，为小皮伞属Marasmius、木耳属Auricularia、灵芝属Ganoderma、光柄菇属Pluteus、栓孔菌属Trametes和炭角菌属Xylaria。广西中越边境喀斯特地区大型真菌区系地理成分可分为8类，以世界广布成分和泛热带分布成分为主，分别有76属和36属。大型真菌资源评价表明，该地区有食用菌59种、药用菌19种、食药兼用菌8种和有毒真菌26种。大型真菌物种受威胁状况统计分析，发现近危物种2种，仅占总数的0.86%，无易危、濒危和极危物种。本研究结果可为该地区大型真菌资源保护保育和可持续利用奠定理论基础。
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火龙果溃疡病对果皮组织微生物群落特征的影响
《热带作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：水果果皮组织的微生物群落有助于提高水果品质和抗病性,但关于火龙果果皮内生微生物的群落结构和多样性的研究报道比较缺乏.本研究采用 Illumina MiSeq 高通量测序技术分析火龙果健康幼果与溃疡病发生初期的罹病果果皮组织内生微生物群落组成及多样性,并预测其群落功能,以了解溃疡病发生初期火龙果果皮内生微生物群落特征.结果表明:在火龙果青果期,健康果和罹病果果皮之间的内生细菌和真菌群落多样性和群落结构差异不显著.健康果果皮的内生微生物中,优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)、异球菌门(Deinococcota)、脱硫杆菌门(Desulfobacterota)和绿弯菌门(Chloroflexi),优势真菌门为子囊菌门(Ascomycota)、真菌未鉴定门(unclassified_k__Fungi)、担子菌门(Basidiomycota)和毛霉门(Mucoromycota).溃疡病发生初期,变形菌门、放线菌门和异球菌门的细菌和子囊菌门的真菌的平均相对丰度显著下降,脱硫杆菌门的细菌和真菌未鉴定门的真菌的平均相对丰度显著上升.随着菌群比例变化,罹病果皮内生细菌的化学异养、需氧化学异养、甲基营养以及甲醇氧化功能的表达量显著下降,内生细菌的潜在致病性类群比例显著提高,内生真菌的腐生营养型、病理营养型和病理-共生营养型的比例显著下降,未知营养型的内生真菌比例显著上升.研究结果提供了火龙果果皮内生微生物的生物信息,为揭示火龙果内生微生物在溃疡病发生中的作用以及利用内生有益微生物功能提供理论依据.
关键词： 火龙果 溃疡病 果皮组织 内生细菌 内生真菌 群落多样性
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广西猫儿山高山湿地植物区系特征与群落演替进程
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：采用样方调查法对广西猫儿山高山湿地湿生草本植物到木本植物阶段的群落类型、物种多样性、演替度和径级结构进行分析，探究植物区系特征与群落演替进程与趋势。结果共记录到维管植物136种，隶属于62科103属，单属科、单种属所占比例大。物种组成的地理成分较为复杂，属的地理分布兼具热带、亚热带和北温带的过渡特征，包含中国特有分布的3个属及特有树种铁杉，多样性程度较高。铁杉湿地很少见，该区域的铁杉湿地却保持得非常原始，保护意义重大。植物种类数量一般会随着演替进程先增加后减少，在演替中后期出现最大值，植物种类丰富度高低并不能很准确地衡量群落的演替程度。根据重要值划分植物群系，比较各演替度，推测出该区域湿生草本植物到木本植物阶段的演替顺序为笄石菖草丛→条穗薹草草丛→尾叶悬钩子灌丛→中华槭灌丛→华西箭竹灌丛→针阔混交林铁杉群落→常绿阔叶林褐叶青冈+山桂花群落→常绿落叶混交林吴茱萸五加林群落，为自然条件下的正向演替。演替的最终结果会形成顶级群落。分析乔木群落优势种的径级结构，在乔木群落阶段演替进程中，各优势种群落发展趋势为铁杉群落波动较大，褐叶青冈和山桂花为稳定群落，以吴茱萸五加为主要落叶树种的种群发展有衰退趋势。故猫儿山高山湿地自然植被还处在进展演替中，未形成最终稳定的森林群落。
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广西沃柑根系内生真菌的多样性分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究清耕和生草措施对沃柑根系内生真菌多样性的影响，为筛选和开发促生、防病和抗逆等功能的有益内生真菌资源提供科学依据。【方法】选取广西南宁市武鸣区6个代表性沃柑果园（生草模式和清耕模式各3个），调查其土壤养分水平，利用高通量测序技术对沃柑根系内生真菌ITS区进行测定，分析沃柑根系样品中真菌群落的多样性及其分布规律。【结果】广西南宁市武鸣区沃柑果园的土壤为酸性，速效钾、有机质含量丰富。从沃柑果树根系样品中共检测出内生真菌12门42纲102目224科416属，其中真菌在门分类水平上的主要优势类群是子囊菌门（Ascomycota），在属分类水平上的主要优势类群为新赤壳属（Neocosmospora）和青霉属（Penicillium），自然生草及清耕模式下的沃柑根系内生真菌群落结构无明显差异。典型相关分析（CCA）结果表明，沃柑果园根系真菌群落与硝态氮、铵态氮、土壤有机质呈极显著相关（P＜0.01），与pH呈显著相关（P＜0.05），与速效磷、速效钾无显著相关性（P＞0.05）。所有试验果园根系中的营养功能类群结构均相似，以腐生—营养型内生真菌菌群的相对丰度最高，其次为未鉴定的功能群、病理—腐生—共生营养型，其他营养功能类群在不同果园中占比均较低。【结论】广西沃柑根系内生真菌以新赤壳属和青霉属为优势属，该区域尺度下的沃柑根系内生真菌群落组成与生草管理无显著相关，但受部分土壤环境因子调控。
关键词： 沃柑 植物内生真菌 群落多样性 FUNGuild 广西
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火龙果茎溃疡病植株茎组织真菌群落特征分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]明确火龙果茎溃疡病对火龙果植株茎组织真菌群落的影响,为揭示火龙果溃疡病发生机制及防治技术研究提供理论依据.[方法]采集火龙果健康植株和溃疡病发病植株茎组织,利用Illumina高通量测序平台对植株茎组织真菌rDNA的ITS序列进行测序,分析健康植株与发病植株茎组织中的真菌群落特征差异.[结果]火龙果健康植株茎组织的真菌群落多样性显著高于发病植株(P<0.05,下同),且健康植株与发病植株茎组织的真菌群落组成具有明显差异.与健康植株相比,发病植株茎组织的子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)相对丰度较高,分别为49.11%和10.90%,门分类水平的未知真菌(unclassified_k_Fungi)的相对丰度较低(39.97%).在属分类水平上,发病植株茎组织存在8个优势属,其中柱节孢属(Neoscytalidium)的相对丰度最高(33.29%),汉纳酵母属(Hannael-la)、Dirkmeia、丛赤壳科未知属(unclassified_f_Nectriaceae)和刺盘孢属(Colletotrichum)4个优势属的相对丰度显著高于健康植株,未在健康植株检测到柱节孢属、维希尼克氏酵母属(Vishniacozyma)和Meira;健康植株茎组织存在4个优势属,其中地霉属(Geotrichum)和链格孢属(Alternaria)的相对丰度显著高于发病植株.线性判别分析(LEfSe)结果显示,发病植株的柱节孢属和维希尼克氏酵母属以及健康植株的地霉属最能解释健康植株与发病植株间的差异.通过比对FUNGuild数据库预测真菌的营养型,发现发病植株中丰度最高的营养型为病理营养型(15.46%),健康植株中丰度最高的营养型是腐生营养型(7.95%).[结论]火龙果发生茎溃疡病后其茎组织的真菌群落多样性显著下降,真菌群落结构发生改变.当病原营养型真菌显著富集在茎组织中时会破坏茎组织的菌群平衡,可能促进了茎溃疡病的发生.
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茅尾海桐花树根际土壤来源几丁质降解菌株多样性及抗植物真菌活性的研究
《中国抗生素杂志 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：目的 以胶体几丁质为唯一碳源的培养基，从广西茅尾海红树林桐花树根际土壤中分离几丁质降解菌株，并应用复筛培养基筛选产几丁质酶菌株，结合平板对峙法挖掘能高效抑制植物病原真菌生长的活性菌株，为红树林来源微生物农用生物防治药物的研发奠定基础。方法 采用平板稀释涂布法和划线法分离纯化菌株，并应用复筛培养基通过透明圈观察法检测菌株几丁质酶活；采用Chelex-100法提取菌株基因组DNA，通过PCR扩增菌株的16S rRNA基因序列，上传至EzBioCloud数据库进行在线比对；采用平板对峙法筛选抗植物病原真菌的活性菌株；采用PKS和NRPS基因的扩增引物分别检测基因组聚酮合酶基因与非核糖体肽合成酶基因。结果 从桐花树根际土壤中分离获得28株几丁质降解菌，隶属于10目10科17属；其中5株几丁质降解菌对4种植物病原真菌均显示出抑菌活性，抑菌活性阳性率为17.86%；并在17株几丁质降解菌中检测到抗生素生物合成基因。结论 广西茅尾海红树林桐花树根际土壤来源的细菌及放线菌是重要的几丁质酶菌种资源，它们在抗植物病原真菌方面表现出良好的应用潜力，在新型绿色海洋生物农药、新颖结构海洋药物及其他高赋值产品开发和利用方面具有应用前景。
关键词： 桐花树根际土壤 几丁质降解菌 多样性 抗菌活性 抗生素生物合成基因
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AA染色体组野生种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性
《江苏农业科学 》 2022 北大核心
摘要：以2份AA染色体组野生种花生为试验材料,扩增分离Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,分析其序列特征、多样性及进化关系.利用根据Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶的保守区设计的简并引物进行PCR扩增,对目的条带进行回收、克隆和测序后,对逆转录酶序列进行生物信息学分析.目的条带大小均约为430 bp,分别从2份AA染色体组野生种花生材料中分离到32、33条逆转录酶序列,对于65条逆转录酶序列,其长度变化范围为397~440 bp,A+T所占比例范围为56.48% ~68.14%,(A+T)/(G+C)为1.3~2.13,核苷酸序列间相似性范围为62.6%~97.9%;65条逆转录酶序列被划分为9个家族,其中家族Ⅰ为主要成分;翻译成氨基酸后,序列间相似性范围为12.4%~98.6%,相比核苷酸序列,氨基酸序列表现出更高的异质性;65条逆转录酶序列中有26条发生了无义突变,2份野生种花生材料的无义突变发生率相当;序列间保守基序大体一致,但也发生了一定的变异,呈现出一定的异质性;9个家族所选代表序列的蛋白质结构总体类似,但也在螺旋结构数、折叠结构数、转角数、氢键数、α-螺旋数、β-折叠数上存在差别;系统进化树显示,所有逆转录酶序列被分为13类,A类和B类中包含大部分逆转录酶序列,E类中的5条AA染色体组野生种花生与其他物种植物的逆转录酶序列具有较高相似性,表明这些序列在进化过程中有可能发生了横向传递;通过比对花生EST数据库,发现3条来自Archis duranensis(PI262133)和2条来自A.duranensis(PI219823)的Ty3-gypsy类逆转座子具有转录活性,本研究为下一步分离Ty3-gypsy类逆转座子全长序列、研究其转录转座活性和功能提供序列基础,也为基于Ty3-gypsy类逆转座子的花生属分子标记开发奠定基础.
关键词： 野生种花生 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 多样性
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果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶基因(RT)序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性,为深入研究果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列、转录转座活性及生物学功能提供理论参考.[方法]以果蔗品种拔地拉为试材,根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因保守区设计简并引物对,利用其进行PCR扩增,将目的条带回收纯化后连接至pMD18-T载体,并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序.依据测序结果对RT基因序列进行生物信息学分析.[结果]从果蔗拔地拉中扩增获得51条序列(SoRT4-1~SoRT4-51),去除重复序列和非RT基因序列后共获得44条RT基因序列,长度为423~433 bp,AT含量为56.84%~64.97%,AT:GC比值为1.32~1.85,核苷酸序列间相似性为44.4%~99.3%,其编码的氨基酸序列间相似性为10.8%~100.0%,说明氨基酸序列比核苷酸序列表现出更高异质性.44条RT基因序列被划分为4个家族,其中Ⅰ和Ⅲ为主要家族.44条RT基因编码的氨基酸序列中有20条发生了无义突变,说明其突变率较高.44条RT基因编码蛋白序列存在5种保守基序,其中,有29条序列同时包含Mo-tif 1~Motif 4,其余15条序列的保守基序变异较大,说明保守基序存在一定异质性.4个家族代表性序列编码蛋白的三级结构在氢键和转角的数量方面差异较大;系统发育进化树分析结果显示,44条RT基因序列被分为七大类,Ⅰ类和Ⅱ类中的果蔗RT基因序列分别占序列总数的40.91%和27.27%,Ⅱ类和Ⅵ类中的部分果蔗RT基因序列与拟南芥的BAB40828.1、粳稻的BAB40824.1、菠菜的BAB40833.1和大豆的BAB40834.1亲缘关系较近,推测这些物种在进化过程中发生了Ty3-gypsy类反转录转座子的横向传递.初步发现1条Ty3-gypsy类反转录转座子(SoRT4-40)具有转录活性.[结论]获得44条果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因序列,其中仅有1条序列具有转录活性,这些RT基因序列可用于开发基于Ty3-gypsy类反转录转座子的甘蔗分子标记.
关键词： 果蔗 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 拔地拉 多样性
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