科研产出
169份不同遗传背景玉米自交系的遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】解析玉米自交系遗传多样性和群体遗传结构，为广西玉米育种实践提供理论参考。【方法】以169份不同遗传背景的玉米自交系为材料，以7份广西骨干自交系和3份我国其他地方的骨干自交系为对照，用10K SNP玉米芯片对其进行全基因组扫描，通过遗传相似度、系统进化、主成分和血缘同源确认（IBD）等分析其遗传多样性及群体遗传结构。【结果】筛选获得7565个高质量可用SNP分子标记，分布在10条染色体上，平均每条染色体上有756个，标记检出率均在97.12%以上，平均检出率达99.57%。174个玉米自交系的杂合率为0.21%～7.28%，平均为0.86%，有144个玉米自交系杂合率不高于1.00%，但有5个玉米自交系的杂合率偏高（31.29%～36.36%）。174份材料间的遗传相似度为0.486～0.999，平均为0.609，其中2个广西选育的西南骨干自交系B24(ZNC442)和CK＿D2（桂A10341）与其他材料间的遗传相似度平均值分别为0.642和0.629。由系统发育进化树可知，包含10个参考自交系在内的179个玉米自交系划分为Reid群和热带亚热带群两大类，其中Reid群含13个自交系，占比为7.26%，热带亚热带群含166个自交系，占比为92.74%。热带亚热带群又可细分为7个亚群，其中以Suwan群和CM群为主，分别含56和51个自交系，占比分别为31.28%和28.49%。主成分分析结果显示，PCA1v3中玉米自交系聚类情况与系统发育进化树聚类结果基本一致，能明显区分Reid群和热带亚热带群，且热带亚热带群中大多自交系分布在CM群和Suwan群参考自交系附近。IBD分群结果显示，Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别有21、47、64和47个。系统进化分析、主成分分析和IBD分群韦恩图显示，三者共属Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别为12、35、18和11个。【结论】广西玉米自交系来源复杂，遗传背景相似，不同分析方法的划分结果并不完全一致，需结合育种实践进行类群划分。广西选育的西南骨干玉米自交系ZNC442和桂A10341均属于A群，最理想组配模式为A群×Reid群，其次是A群×Suwan群和A群×CM群。
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基于SNP芯片划分CIMMYT和广西玉米自交系杂种优势群
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：CIMMYT玉米自交系在广西具有较好的适应性，目前利用CIMMYT和广西玉米自交系杂交已成功选育出许多适合广西种植的玉米新品种。为了解CIMMYT和广西玉米自交系间的杂种优势关系，本研究以20份CIMMYT自交系和169份广西自交系为供试材料，以5份中国骨干自交系和4份广西骨干自交系作为参照系，利用10K玉米SNP芯片进行全基因组扫描，开展遗传相似性、系统进化树和主成分分析，划分参试材料的杂种优势群。研究结果表明，189份玉米自交系绝大多数杂合率均小于10%，纯合度较高。CIMMYT自交系相互间遗传相似性较高，与广西玉米自交系间遗传相似度较低。进化树和主成分分析将189份自交系分为PB群、SPT群、‘桂单162-0810’母本群、‘桂单162’父本群、‘桂单0810’父本群和其他类群，其中大部分CIMMYT玉米自交系属于SPT群，大部分广西玉米自交系属于‘桂单162-0810’母本群、‘桂单0810’父本群和其他类群。可见，CIMMYT与广西玉米自交系间遗传差异较大，大多属于不同杂种优势群，两类自交系进行杂交能够较大概率获得优良玉米品种。
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