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基于转录组测序的辅助鉴定南方大豆皱叶症分子标记开发

南方农业学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:【目的】基于转录组测序(RNA-Seq)开发辅助鉴定南方大豆皱叶症(SSCLD)的分子标记,为快速鉴定生产上遇到的大豆皱叶是否为SSCLD提供技术支撑。【方法】利用转录组测序技术分析遗传背景相近的皱叶大豆和正常叶大豆材料在皱叶症诱导环境下的差异表达基因(DEGs),从中去除核苷酸序列高度相似的同源序列,筛选出表达差异较大的DEGs进行分子标记开发,利用皱叶大豆材料和逆境处理试验评价分子标记的表达专一性,并利用不同类型的皱叶表型样本对分子标记进行表达专一性及可靠性验证。【结果】7株皱叶植株样本和5株正常叶植株样本的测序碱基错误率为0.0226~0.0238,Q20和Q30分别在99.00%和99.90%以上的碱基数量占总碱基数量均大于95.00%,GC含量为45.60%~46.24%,表明转录组测序数据质量较好。皱叶大豆材料较正常叶大豆材料有1063个DEGs上调表达,85个DEGs下调表达。根据基因的表达量和同源性,共筛选8个DEGs用作开发分子标记的候选基因,均表现为明显上调表达。8个候选基因的实时荧光定量PCR检测结果与转录组数据基本相符。此外,所筛选基因中有6个基因表达在不同程度上受干旱、水渍、冷害、荫蔽和盐胁迫等逆境胁迫诱导,其中,种植于皱叶症土壤中的皱叶型株系叶片GLYMA_18G033400基因的相对表达量均高于其在正常土壤中受干旱、水渍、冷害、荫蔽和盐等逆境胁迫后的相对表达量。根据GLYMA_18G033400基因序列设计分子标记qCL-18G033400,并用该分子标记对19份不同皱叶类型的叶片样品进行实时荧光定量PCR检测,结果发现,以ΔCt值小于10.00作为SSCLD的判定标准,分子标记鉴定结果同田间鉴定结果一致。【结论】利用转录组测序技术开发的分子标记qCL-18G033400可辅助鉴定SSCLD。

关键词: 大豆 皱叶症 分子标记 开发 转录组 辅助鉴定

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植物源天然食用色素及其开发利用研究进展

食品研究与开发 2012 北大核心

摘要:植物源天然食用色素色调自然,安全性高,有些兼具营养和药理作用,目前已逐渐替代人工合成色素。结合近年来的研究,从植物源天然色素的发展历史、分类、性质特点及适用范围、提取与纯化方法、分析鉴定及筛选等几个方面进行系统的论述。以期为植物源天然食用色素的深入研究及其开发利用奠定理论基础。

关键词: 植物源 食用色素 开发 利用 理论基础

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岑王老山自然保护区药用植物资源及其开发

资源开发与市场 2007

摘要:岑王老山自然保护区内药用植物资源丰富,通过查阅相关文献,初步确定有药用植物186科666属1186种,并提出了保护区内药用植物资源的开发途径,对其中具有开发前景的种类做了重点介绍,为保护和合理开发保护区内药用植物资源提供参考。

关键词: 岑王老山自然保护区 药用植物资源 开发

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糖厂10月开榨配套技术研究与开发的进展

甘蔗糖业 2003

摘要:1999~2002年,由广西甘蔗研究所和广西凤糖生化股份有限公司共同实施了“糖厂10月开榨原料蔗配套技术的研究与开发”项目(桂经贸字[1999]459号)。经过3年多的实施,项目取得了很大的进展,主要是:筛选了适合10月开榨所需的特早熟品种,如R0C16、R0C20、桂引选3号、轻引98-3和农林8号等;成功地进行了特早熟品种R0C16、R0C20、桂引选3号和轻引98-3的产业化开发,面积达18836hm~2:初步形成了适合10月开榨的配套技术体系,包括种植特早熟品种、调整植期、合理施肥、提早管理、使用催熟剂和加强砍运榨管理等;成功地开发了R0C16、R0C20、桂引选3号和轻引98-3的等品种的特早熟功能和糖厂资源功能,进行了10月25日开榨实践,取得良好的经济效益和社会效益。项目技术对提高糖厂经济效益、延长榨季、减轻可能的霜冻为害等具有重要意义。

关键词: 甘蔗 10月 开榨 配套技术 开发 进展

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