科研产出
花生预苯胺酸脱氢酶基因AhADH的克隆及分子特性分析
《分子植物育种 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：通过改良的RACE技术从花生中分离并克隆出ADH全长cDNA序列,并命名为AhADH,其全长为1 155 bp,含一个编码269个氨基酸,长度为810 bp的开放阅读框。生物信息学分析显示AhADH蛋白的分子质量是30.65 kD,理论等电点是6.07,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成。序列比对表明花生ADH氨基酸序列含预苯酸/预苯胺酸脱氢酶结构域,且与多种其他植物的ADH具有高度同源性。qRT-PCR分析表明该基因具有组织表达差异性,且在茎中表达量最高。
关键词： 维生素E 预苯胺酸脱氢酶 花生 生物信息学分析 组织表达谱
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甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析
《热带作物学报 》 2012 CSCD
摘要：采用RT-PCR技术克隆了甘蔗核苷二磷酸激酶基因全长cDNA,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况。结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为686 bp,包括1个450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,GenBank登录号为JQ712580。甘蔗与高粱NDPK基因cDNA序列的同源性为96%,氨基酸序列同源性为98%;该基因推导的蛋白分子量大小为16.83 ku,等电点为6.58,疏水性分值在-2.089～2.033;蛋白二级结构中α-螺旋占44.3%,随机卷曲占24.83%,延伸链占20.13%,β-转角只占10.74%。实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,NDPK1基因表达均呈先升高后降低的趋势,30 h达最大;在处理后的18、30、40 h,PEG与PEG+Si处理的NDPK1基因的表达量有显著差异。
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