科研产出
基于rDNA序列分析的3种丛枝菌根真菌分子鉴定方法比较
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】比较基于rDNA序列分析的3种丛枝菌根（AM）真菌分子鉴定方法，为提高AM真菌在种水平分子鉴定的准确性提供参考。【方法】对从柑橘和甘蔗等广西地区主要作物的根际土壤中分离出的AM真菌菌株（编号为A6、B3和GY3-1）进行形态学鉴定，再通过巢式PCR分别扩增AM真菌的18SrDNA、28Sr DNA及含ITS1、5.8SrDNA和ITS2的序列（简写为ITS1+5.8S+ITS2），分别将其测序结果与GenBank数据库进行比对，并构建系统发育进化树，再结合形态学鉴定结果比较基于3个r DNA序列分析分子鉴定方法的准确性。【结果】菌株A6、B3和GY3-1的形态特征分别与幼套近明球囊霉（Claroideoglomus etunicatum）、黏质隔球囊霉（Septoglomus viscosum）和摩西斗管囊霉（Funneliformismosseae）一致。基于18SrDNA序列，将菌株A6鉴定为近明球囊霉属（Claroideoglomus），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F. moessae），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum）。基于28S rDNA序列，将菌株A6鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F. moessae）。基于ITS1+5.8S+ITS2序列，将菌株A6鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F.moessae）。而综合3种分子鉴定结果，菌株A6、B3和GY3-1分别鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum）、黏质隔球囊霉（S. viscosum）和摩西斗管囊霉（F. mosseae）。【结论】3种方式均可用于AM真菌的在种水平上的分子鉴定，以18S rDNA与28S rDNA为主的鉴定方法相对简单且快速，更适用于对AM真菌在属水平的鉴定；以ITS1+5.8S+ITS2为主的鉴定方法步骤较繁琐，但鉴定至种水平的准确性较高。3种方法的分析结果在一定程度上可互相补充，加强对AM真菌分子鉴定结果的准确性。
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木薯品种华南12号(SC12)同源四倍体诱导及鉴定
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：多倍化可伴随产生一些优良的农艺性状,如抗逆性增强、器官体积变大、生物量增加等,多倍体育种为木薯新品种培育提供了一个重要途径.本研究以木薯品种SC12 离体单芽茎段为诱导材料,比较不同浓度秋水仙素对外植体诱导率的影响,并对木薯二倍体与同源四倍体不同株系进行形态学、解剖学和农艺特性比较.结果表明,以 0.03 g/L浓度的秋水仙素诱导 SC12 同源四倍体效率最高,为 7.78%;通过流式细胞仪和根尖染色体数目观察对筛选的 20 个植株进行倍性鉴定,获得了 11 个同源四倍体和 5 个嵌合体植株,同源四倍体为检测株系的 55%,变异植株为检测株系的80%;二倍体和同源四倍体植株表现出显著的形态和生理差异,在形态上表现为四倍体植株变矮、茎杆变粗、叶尖盾化,叶片由披针形向拱形过渡,同源四倍体裂叶长/裂叶宽显著降低、叶绿素含量显著增加;通过解剖学发现四倍体叶片保卫细胞的长、宽、叶绿体数目均显著增加,分别比二倍体增加 2.33%、28.99%、117.79%;气孔数显著降低,比二倍体减少 40.06%;四倍体变异株保卫细胞呈椭圆形,二倍体保卫细胞趋近于圆柱形;四倍体叶片厚度和栅栏组织厚度均显著高于二倍体,比对照分别增加 24.41%、43.88%,栅栏组织/海绵组织是二倍体的 1.9 倍,表明四倍体叶片的栅栏组织排列紧密,但海绵组织不发达.测产结果表明,多倍体株系SC12-11 的单株薯重和收获指数分别为 3.30 kg和 0.43,显著高于对照二倍体SC12.
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木薯少根根霉分离、鉴定及其对淀粉消化特性分析
《农业研究与应用 》 2023
摘要：微生物侵染木薯块根导致病变而腐败，通过对木薯少根根霉菌株（Ca-201613）的鉴定、优化培养，对衍生产物及其淀粉消化功能研究。结果表明：（1）菌株最适培养温度为35.0℃，属于嗜热型真菌，而≥40.00℃会抑制生长；（2）添加20.0 g/L葡萄糖的培养条件下，获得菌株最高生长量和代谢衍生物产量，而≥30.0 g/L会抑制生长；（3）添加10.0 g/L木薯淀粉，有利于促进菌株生长和代谢；（4）菌株代谢物的鉴定得到853个化合物，包括腺苷类、酸类、脂类和激素类；（5）菌株GR891和SC9块根的衍生物中检测出8种可溶性单糖，总糖含量为381.36μg/mg和399.55μg/mg，其中葡萄糖含量占87.42%～92.30%。木薯少根根霉是对淀粉具有糖化功能的益生菌株，为菌株“变弊为利”应用提供理论依据。
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广西澳洲坚果干花病病原菌鉴定
《植物保护 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：笔者于2022年4月在广西南亚热带农业科学研究所澳洲坚果种质资源圃内发现澳洲坚果干花病,该病害危害花序,造成花瓣变褐、花序轴干枯甚至整个花序干枯死亡.本研究根据柯赫氏法则鉴定病原菌,并依据其形态学特征及TEF-TUB-ITS多基因联合建树明确病原种类,结果显示其致病菌为亚洲新拟盘多毛孢Neopestalotiopsis asiatica与腐生新拟盘多毛孢N.saprophytica.这是亚洲新拟盘多毛孢与腐生新拟盘多毛孢造成澳洲坚果干花病的首次报道.
关键词： 澳洲坚果干花病 亚洲新拟盘多毛孢 腐生新拟盘多毛孢 病原鉴定
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海南地区冬春作甜瓜病毒病病原鉴定与分析
《中国蔬菜 》 2023 北大核心
摘要：为探明海南地区冬春作甜瓜病毒病的主要病原种类和危害情况,2022—2023年冬春季从海南甜瓜主产区采集34份疑似感染病毒病的甜瓜样品,利用高通量测序(high-throughput sequencing)和聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术对甜瓜病毒病的病原种类进行鉴定和分析.结果表明:甜瓜黄斑病毒(melon yellow spot virus,MYSV)、西瓜银斑驳病毒(watermelon silver mottle virus,WSMoV)和中国南瓜曲叶病毒(squash leaf curl China virus,SLCCNV)引起的甜瓜病毒病在海南多个产区普遍发生.其中,MYSV检出率最高,为73.53%;其次为WSMoV,检出率61.76%;且呈现MYSV和WSMoV复合侵染现象,复合侵染率为47.06%.
关键词： 甜瓜病毒病 甜瓜黄斑病毒 西瓜银斑驳病毒 中国南瓜曲叶病毒 分类鉴定
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番茄斑驳花叶病毒在广东省的首次报道
《植物保护 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：番茄斑驳花叶病毒（tomato mottle mosaic virus, ToMMV）是2013年发现的烟草花叶病毒属一个新种，目前在多国（地区）有发生。本文采用小RNA深度测序及RT-PCR检测方法在广东省广州市南沙区辣椒疑似病样中检测到ToMMV,命名为番茄斑驳花叶病毒广东分离物（ToMMV-GD-2020）。采用RT-PCR分段扩增获得了ToMMV-GD-2020的基因组全序列，该分离物基因组全长6 399 nt,包含4个开放阅读框，分别编码4个蛋白。序列相似性分析表明，ToMMV-GD-2020与已登录GenBank的14个ToMMV分离物基因组序列相似性分别为99.0%～99.7%,其中与中国辽宁分离物ToMMV-LN（GenBank登录号：MN853592）的相似性最高（99.7%）,与危害我国番茄、同属烟草花叶病毒属的番茄花叶病毒（tomato mosaic virus, ToMV）、番茄褐色皱果病毒（tomato brown rugose fruit virus, ToBRFV）代表分离物的相似性分别为84.6%和81.0%。系统进化分析表明，ToMMV-GD-2020与该病毒各分离物亲缘关系均较近，与中国辽宁分离物亲缘关系最近。利用ToMMV的PCR特异引物对广东其他6个市采集的67份辣椒疑似病毒病样品进行检测，结果均为阴性，这说明ToMMV目前还是局部危害广东省辣椒。本文是首次报道在广东发现ToMMV,对监测ToMMV在我国的扩散具有重要意义。
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具有固氮和耐酸特性甘蔗属野生割手密的筛选与鉴定
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]开展甘蔗属野生割手密种质资源农艺性状和固氮能力评价鉴定,筛选兼具固氮和耐酸特性的特异种质,为我国甘蔗属野生割手密种质资源创新和品种选育提供参考依据.[方法]以33份甘蔗属野生割手密种质为试验材料,采用相关分析、聚类分析和基因组克隆等方法,测定其株高、总茎数、锤度、干物率和固氮酶活性,克隆其内生固氮菌nifH基因,分析其固氮酶活性及酸胁迫下的根重和根系活力等指标,筛选出综合性状优良的固氮割手密材料,最终鉴定出兼具固氮和耐酸特性的割手密种质.[结果]参试割手密种质遗传多样性丰富,株高、总茎数、锤度、干物率和固氮酶活性的平均变异系数分别为31.73%、37.22%、40.69%、6.77%和59.22%,其中固氮酶活性的变异最大,说明这些割手密种质中存在固氮能力变异丰富的类型.相关分析结果表明,干物率与锤度、固氮酶活性与总茎数呈显著正相关(P<0.05,下同),干物率与总茎数呈显著负相关.聚类分析结果表明,在欧式距离8.51处可将33份割手密种质划分为4个类群,聚类结果与种质本身特性具有一定的一致性,其中,第4类群中的6份割手密种质为多茎的高固氮组合,第3类群的4份割手密种质均具有植株矮小和干物率低的特点;根据地域来源对33份割手密种质不能明显聚类,但具有较多相同性状特征的种质能聚在一起,说明割手密种质的表型和固氮能力在长期演化和自然选择过程中发生了显著变化.在种质GSM177和GSM03体内克隆到大量具有固氮基因nifH的固氮菌,进一步证实GSM177和GSM03是固氮型割手密种质.耐酸筛选试验结果表明,种质GSM177和GSM03对酸性土壤的耐受程度存在明显差异,其中,种质GSM177较能耐受酸性土壤环境,GSM03是典型的酸敏感型割手密种质.[结论]GSM177是兼具固氮和耐酸特性且综合性状优良的甘蔗属野生割手密种质资源,可在固氮和耐酸甘蔗品种选育中利用.
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广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：采用小RNA(sRNA)深度测序技术,结合RT-PCR技术对广西9个辣椒主产区具有典型病毒病症状的病样进行检测,共发现10种病毒,其中小米椒内源RNA病毒1(Capsicum frutescens endornavirus 1,CFEV 1)、辣椒潜隐病毒 2(pepper cryptic virus 2,PCV 2)、烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和辣椒黄脉病毒(pepper vein yellows virus,PeVYV)是在广西辣椒上首次发现,且CFEV 1在中国是首次发现.10种病毒在75份辣椒病样中的总检出率为8.00%~66.67%,前5位依次为辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV,66.67%)、甜椒脉斑驳病毒(pepper veinal mottle virus,PVMV,62.67%)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV,41.33%)、CFEV 1(32.0%)以及PCV 2(26.67%).ChiVMV、PVMV、CMV和CFEV 1在广西7~9个辣椒主产区广泛分布,推测为优势病毒.除桂林外,其他8个辣椒主产区均含以上4种优势病毒中的1~3种,但在桂林,这4种病毒的检出率偏低或检不出,其优势病毒种类是PMMoV和PCV2.广西辣椒病毒病复合侵染率为94.66%,3种(检出率42.67%)和4种(检出率24.00%)病毒复合侵染是主要形式.3种复合侵染中以ChiVMV+PVMV+CMV 和 ChiVMV+CFEV 1+ChiRSV 占比最高(均为 18.75%),4 种复合侵染中以 ChiVMV+PVMV+CMV+CFEV 1 占比最高(16.67%).
关键词： 辣椒 病毒病 小RNA 深度测序 RT-PCR 分子鉴定
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广西荔浦槟榔芋软腐病病原鉴定
《农业研究与应用 》 2022
摘要：从广西荔浦槟榔芋栽培区患芋软腐病的发病植株中分离纯化获得一株优势明显的菌株.电镜显微下,该菌菌体为短杆状,无芽孢产生,具鞭毛.致病性测定试验发现该菌株发病症状与田间芋软腐病症状一致.对该菌株进行生理生化分析,发现其符合胡萝卜果胶杆菌Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum的特性.16S rDNA、icdA、mdh、mtld、proA多基因联合分析结果表明该菌株与P.carotovorum subsp.carotovorum PC1(GenBank Accession No.CP001657.1)相似.综合该菌株致病性、形态学、生理生化等特征特性及多基因序列分析,将引起槟榔芋软腐病的病原菌鉴定为Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum.
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