您好，欢迎访问广西农业科学院 机构知识库！

玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 宋燕春 1 ; 石云素 1 ; 程伟东 2 ; 吴子恺 2 ; 王天宇 1 ; 黎裕 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

2.广西大学农学院

关键词： Rubisco活化酶(RCA);单核苷酸多态性(SNP);InDel;连锁不平衡(LD);单倍型;单倍型标签SNP

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2011 年 37 卷 01 期

页码： 58-66

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。

  • 相关文献

[1]基于SNP分子标记的澳洲坚果种质遗传多样性分析. 谭秋锦,王文林,陈海生,韦媛荣,郑树芳,黄锡云,贺鹏,夏志强. 2020

[2]禾荔特晚熟焦核突变体GLL-1全基因组变异分析. 丁峰,李浩然,王金英,彭宏祥,何新华,黄小雄,李平,钟敏芝,覃燕,张树伟. 2021

[3]关联分析及其在植物遗传学研究中的应用. 吴子恺,程伟东,王天宇,黎裕. 2011

[4]基于线粒体基因序列的广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构分析. 邓铁军,杨丽婷,雷薇,刘丽辉,刘吉敏,陈琦. 2024

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：广西农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台