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基于SNP标记揭示广西糯玉米地方品种的遗传多样性与群体遗传结构

文献类型： 中文期刊

作者： 范競升 1 ; 谢和霞 2 ; 谢小东 2 ; 周海宇 2 ; 程伟东 2 ; 覃兰秋 2 ; 江禹奉 2 ;

作者机构： 1.广西亚热带作物研究所

2.广西壮族自治区农业科学院玉米研究所/国家玉米改良中心广西分中心

关键词： 糯玉米;地方品种;遗传多样性;SNP标记

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 661-670

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了挖掘优异糯玉米种质资源，提高糯玉米育种效率，本研究利用10K玉米基因芯片对207个广西糯玉米地方品种和6份参考自交系进行全基因组扫描，解析广西糯玉米地方品种之间的遗传多样性与群体遗传结构。结果表明，广西糯玉米种群总体的遗传多样性较高，平均期望杂合度（He）为0.31，平均观察杂合度（Ho）为0.23，多态信息含量（PIC）平均值为0.25，最小等位基因频率（MAF）平均值为0.23。种群水平上，桂中区域的遗传多样性水平最高（He=0.32,Ho=0.24,MAF=0.24,PIC=0.26）。群体遗传结构分析将地方品种划分为4大类群，种群间遗传关系和类群归属与地理位置不完全相关，品种间总体遗传相似系数偏低，遗传多样性丰富。分子变异方差分析结果显示99%的遗传变异来自种群内。群体间遗传分化系数（FST）为0.008，群体间分化程度较低。研究结果确定了广西不同区域糯玉米地方品种多态性及亲缘关系，为广西糯玉米种质改良和指导新品种培育提供理论依据。

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