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蛋黄果SCoT-PCR反应体系的建立与优化

文献类型: 中文期刊

作者: 周彩霞 1 ; 李文砚 1 ; 卢美瑛 1 ; 周之珞 1 ; 颜桢灵 1 ; 韦雪英 1 ; 卓福昌 1 ; 韦优 1 ; 周婧 1 ;

作者机构: 1.广西南亚热带农业科学研究所

关键词: 蛋黄果;SCoT-PCR;正交试验;Taq聚合酶;dNTPs浓度

期刊名称: 中国南方果树

ISSN: 1007-1431

年卷期: 2024 年 53 卷 002 期

页码: 112-116

收录情况: 北大核心

摘要: 为建立和优化蛋黄果SCoT-PCR反应体系,以"仙桃1号"蛋黄果为试材,SCoT1为引物,采用L16(45)正交试验,对影响SCoT-PCR反应的DNA、Mg2+、dNTPs、引物及Taq聚合酶等因素进行优化;并选用3份地理位置相距较远的蛋黄果种质为模板,对优化反应体系进行验证.结果表明,不同因素对蛋黄果SCoT-PCR反应体系的影响存在差异,但不显著,其中最大的影响因素是Taq聚合酶含量,其次是dNTPs浓度、模板DNA含量、引物浓度和Mg2+浓度.蛋黄果SCoT-PCR 最佳反应体系(20 μL)为模板 DNA 80 ng、3 mmol/L Mg2+、0.25 mmol/L dNTPs、0.4 μmol/L引物、Taq 2 U.在该体系下,3份蛋黄果种质均能稳定扩增出清晰明亮、数目丰富且稳定性高的条带,说明优化的SCoT-PCR反应体系适用于蛋黄果SCoT分子标记.

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