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澳洲坚果MiMYB2基因克隆及结构与功能分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王文林 1 ; 陈海生 1 ; 郑树芳 1 ; 樊松乐 2 ; 王立丰 3 ; 谭秋锦 1 ; 覃振师 1 ; 黄锡云 1 ; 贺鹏 1 ; 汤秀华 1 ; 许鹏 1 ;

作者机构: 1.广西南亚热带农业科学研究所

2.海南大学热带作物学院

3.农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词: 澳洲坚果;MiMYB2;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称: 植物研究

ISSN: 1673-5102

年卷期: 2020 年 40 卷 006 期

页码: 913-922

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究R2R3-MYB转录因子家族成员在澳洲坚果生长发育和产量形成中的作用机制,利用PCR技术从澳洲坚果品种“桂热一号”叶片中克隆MiMYB2基因并采用生物信息学对其结构及功能进行分析.结果 表明,克隆获得的MiMYB2(NCBI登录号:MN254976)基因cDNA序列全长1 210 bp,开放阅读框(ORF)1 002 bp,编码333个氨基酸.MiMYB2编码一个无跨膜结构、无信号肽且定位于细胞核的不稳定亲水蛋白,含两个SANT保守结构域,属于R2R3-MYB家族.BLAST分析发现MiMYB2与荷花NnMYB3-1ike氨基酸序列同源性最高.系统进化分析将MiMYB2与AtMYB17、AtMYB106和AtMYB16聚类为S9亚族.通过转录组数据分析MiMYB2基因在“桂热一号”和“695”品种澳洲坚果枝条、花和叶片中的表达模式,表明MiMYB2在“桂热一号”品种花中的表达量最低,“695”品种花中的表达量最高.推测MiMYB2与澳洲坚果花生长发育密切相关.本研究为阐明MiMYB2基因在澳洲坚果生长发育和产量形成中的作用机制提供理论参考.

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