您好,欢迎访问广西农业科学院 机构知识库!

菜心种质资源遗传多样性的SCoT分析

文献类型: 中文期刊

作者: 琚茜茜 1 ; 张力 1 ; 罗海玲 1 ; 熊发前 2 ; 康红卫 1 ;

作者机构: 1.广西农业科学院蔬菜研究所

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词: 菜心;遗传多样性;SCoT;聚类分析

期刊名称: 南方农业学报

ISSN: 2095-1191

年卷期: 2015 年 46 卷 08 期

页码: 1350-1355

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】利用SCo T标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据。【方法】搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCo T引物对其进行遗传多样性分析。【结果】12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63%~57.89%,平均多态性百分率为36.00%;每条引物多态性条带变化范围为4~9条,平均3.4条;扩增片段大小为500~1500 bp。观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon’s信息多样性指数(I)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei’s遗传距离为0.428。AMOVA分析发现,81%的变异来源于品种内,19%的变异来源于品种间。聚类分析结果表明,在Nei’s遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种。【结论】SCo T标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCo T标记归类;SCo T标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测。

  • 相关文献

[1]利用SCoT检测菜心F_2分离群体的遗传多样性. 罗海玲,史卫东,康红卫,张力,熊发前,农贵雄. 2018

[2]广西西北部高原地区柿种质资源调查及遗传多样性分析. 何新华,李天文,胡颖. 2012

[3]不同龙眼资源遗传多样性的SCoT和ISSR比较分析. 何新华,黄桂香,李峰,姜建初,朱建华. 2012

[4]基于ISSR与SCoT分子标记的赤苍藤种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建. 杨天为,黄诗宇,张尚文,高曼熔,张向军,李婷,庾韦花,蒙平,石前. 2023

[5]36份菠萝种质的遗传多样性SCoT分析. 苏伟强,刘业强,任惠,陆玉英. 2012

[6]SCoT分子标记技术在木薯遗传多样性分析中的应用. 单建伟,冯斗,严华兵. 2015

[7]龙眼24个品种的SCoT遗传多样性分析. 何新华,罗聪,朱建华,李峰. 2010

[8]菜心种质资源的主成分与聚类分析. 史卫东,陈振东,农贵雄,罗海玲,康红卫,韦爱培. 2019

[9]菜心和芥蓝表型多样性的主成分分析与聚类分析. 史卫东,梁劲,张力,琚茜茜,罗海玲,康红卫. 2020

[10]Phenotypic Variation and Genetic Diversity in the Collections of Erianthus Arundinaceus (Retz.) Jesw. Li, Yang-Rui,Liu, Xi-Hui,Song, Huan-Zhong,Zhang, Ge-Min,Duan, Wei-Xing,Zhang, Rong-Hua,Li, Yang-Rui. 2017

[11]广西龙荔资源居群遗传多样性ISSR分析. 潘丽梅,秦献泉,彭宏祥. 2012

[12]基于SCoT分子标记的48份杨桃种质遗传多样性分析. 欧景莉,朱杨帆,陈豪军,周俊岸,陈燕,何江,宁琳,潘祖建,甘卫堂. 2019

[13]16份桄榔种质主要农艺性状的遗传多样性分析. 兰秀,杨海霞,李恒锐,梁振华,马仙花,刘连军,陈海生. 2022

[14]不同基因型甘蔗种质遗传特性分析. 杨翠凤,张春雅,滕峥,杨丽涛,李杨瑞. 2018

[15]基于ISSR标记分析油梨种质的遗传多样性. 周海兰,李绍鹏,周俊岸,庞新华,欧景莉,潘祖建,李菊馨,唐秀观,李茂富. 2021

[16]基于SSR分子标记的油梨种质遗传多样性分析. 周海兰,李绍鹏,李茂富,庞新华,周俊岸,欧景莉,李菊馨,单彬,唐桓伟,李季东. 2021

[17]基于表型性状的广西茶树种质资源遗传多样性分析. . 2019

[18]70份毛葡萄种质资源遗传多样性的SSR分析. 杨柳,黄大辉,吴代东,张进忠,赵明,林茜,潘永杰,林贵美. 2013

[19]苦瓜遗传多样性的形态学性状聚类分析. 孙德利,张曼,方锋学,罗海玲. 2008

[20]广西原产和引种荔枝种质资源的遗传多样性 分析及核心种质构建. 李冬波,徐宁,秦献泉,李鸿莉,侯延杰,邱宏业,张树伟,朱建华,彭宏祥. 2020

作者其他论文 更多>>