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基于引物扩增受阻突变技术开发水稻耐冷基因CTB4a特异性分子标记

文献类型： 中文期刊

作者： 梁海福 1 ; 潘英华 1 ; 刘开强 2 ; 邓国富 2 ; 黄娟 2 ; 卿东进 2 ; 高菊 2 ; 伍豪 2 ; 高利军 2 ;

作者机构： 1.广西壮族自治区农业科学院水稻研究所广西水稻遗传育种重点实验室

2.广西壮族自治区农业科学院作物遗传改良生物技术重点开放实验室

关键词： 耐冷基因;CTB4a;分子标记

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 1719-1724

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水稻（Oryza sativa）作为热带与亚热带起源的作物对低温敏感。对水稻种质进行耐冷性鉴定,能筛选出耐冷性强的种质,发展耐冷基因分子标记,能够有效鉴别种质中耐冷基因的基因型。本研究使用芽期4℃低温处理10 d对41份水稻材料进行芽期耐冷鉴定,对品种的芽期耐冷能力进行评价,获得了参试材料中除了‘昆明小白谷’之外的芽期耐冷性最强的品种‘南特号’。对已克隆的耐冷基因CTB4a开发分子标记,能够辅助选择水稻的耐冷育种。水稻孕穗期耐冷基因CTB4a来源于‘昆明小白谷’,能够影响水稻抵抗低温的能力。参照公布的CTB4a序列信息,从中挑选出序列中的作用位点SNP （单核苷酸多态性, single nucleotide polymorphism）,结合引物扩增受阻突变技术（Penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS）,用Primer 6.0设计引物,建立CTB4a基因荧光分子标记GM-CTB4a,使用荧光分子标记GM-CTB4a对41份水稻品种进行鉴定,使用酶标仪在‘昆明小白谷’中检测到利用标记扩增产物中包含‘昆明小白谷’特异SNP、T碱基引物携带的FAM荧光信号,在另外40份品种的扩增产物中检测到包含作用位点的C碱基引物携带的HEX荧光信号。本研究利用设计的分子标记,鉴定了41份水稻品种的耐冷性和基因型。比对分析耐冷性和基因型鉴定结果,说明我们开发的分子标记GM-CTB4a特异性较强,具有实际应用价值。研究结果为利用水稻孕穗期耐冷基因CTB4a培育强耐冷水稻品种奠定坚实基础。

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