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基于SSR分子标记的油梨种质遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周海兰 1 ; 李绍鹏 2 ; 李茂富 2 ; 庞新华 1 ; 周俊岸 1 ; 欧景莉 1 ; 李菊馨 1 ; 单彬 1 ; 唐桓伟 1 ; 李季东 1 ;

作者机构: 1.广西亚热带作物研究所

2.海南大学热带农林学院

关键词: 油梨;遗传多样性;SSR标记;聚类分析;主成分分析

期刊名称: 中国南方果树

ISSN: 1007-1431

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 31-37

收录情况: 北大核心

摘要: 用23对SSR多态性引物对收集的54份油梨种质材料进行PCR扩增,利用Popgene 1.32计算遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数,并进行UPGMA聚类分析和主成分分析。结果表明,23对SSR引物共扩增出多态性位点119个,每对引物扩增的多态位点在2~10个之间,平均为5.17个,多态性位点百分比(PPL)为100%;多态性信息量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I)分别为0.33、1.321 9、0.205 9、0.335 6。54份油梨种质资源的遗传相似系数在0.59~0.97之间,在0.71处可划分为4大类群,Fuerte单独归为第Ⅰ类,Hass、Bacon为第Ⅱ类,第Ⅲ类的种质包括Y1-10、Y3-1、Y6-5、Y10-1,余下47份归为第Ⅳ类,占参试材料的87.04%,主成分分析结果与聚类分析结果基本一致。

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