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木薯MeAFP2-like基因的序列特征及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖亮 1 ; 尚小红 1 ; 单忠英 1 ; 曹升 1 ; 曾文丹 1 ; 严华兵 1 ;

作者机构: 1.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室;广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所

关键词: 木薯;MeAFP2-like基因;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 16 卷 20 期

页码: 6566-6571

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: AFP2基因被认为是植物脱落酸(ABA)信号转导途径的一个重要组分。为了研究木薯中AFP2基因的分子功能,本研究从木薯品种‘新选048’中克隆到一个AFP2基因。结果表明,AFP2-like基因的编码区全长为1 113 bp,编码370个氨基酸,该基因编码的氨基酸符合AFP基因家族的序列特征,含有EAR、NINJA_B和Jas等结构域,该基因被命名为MeAFP2-like。Blastn序列比对发现,MeAFP2-like氨基酸序列和橡胶树HbAFP2 (XP_021636423)序列相似性最高,为91%;系统进化树分析发现MeAFP2-like与橡胶树HbAFP2,蓖麻RcAFP2聚为一支;荧光定量PCR结果表明,MeAFP2-like基因在根中表达量最高,在叶片中表达量居中,在茎秆中表达量最低。这些结果为进一步研究该基因的功能提供了帮助。

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