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基于SSR分子标记的广西柿种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何新华 1 ; 卢家仕 2 ; 覃振师 3 ;

作者机构： 1.广西百色国家农业科技园区管理委员会

2.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

3.广西亚热带作物研究所试验站

关键词： 柿属;种质资源;SSR;遗传多样性;广西

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2014 年 45 卷 11 期

页码： 1903-1909

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】采用SSR标记技术分析广西柿种质资源的遗传多样性,为其资源的分类、鉴定、保护和开发利用提供依据。【方法】设计48对SSR引物,对从广西不同生态气候区收集的93份柿种质资源进行PCR扩增、聚类分析和主成分分析,探讨不同种质资源的遗传多样性和亲缘关系。【结果】在48对引物中,15对SSR引物可从93份柿种质中扩增获得159条带,多态性条带比例为96.86%;各种质间的遗传相似系数在0.478~0.925,平均为0.667。聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.640处可将93份柿种质资源分为A、B、C、D 4组,其中柿栽培种、油柿和君迁子分属不同组中,野柿与柿栽培种间存在交叉现象。主成分分析结果表明,前三主成分贡献率依次为14.18%、5.25%和4.11%,累积贡献率为23.54%;主成分分析可将93份柿种质材料分为四大类,与聚类分析结果基本一致。【结论】广西柿种质资源遗传背景广、多样性较丰富,可为柿资源开发利用和新品种选育提供重要材料;SSR分子标记可作为柿种质资源分类和鉴定的可靠工具。

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