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广西地方稻种资源核心种质红色种皮全基因组关联分析及鉴定两个新的Rc等位基因

文献类型: 中文期刊

作者: 农保选 1 ; 夏秀忠 1 ; 张宗琼 1 ; 曾宇 1 ; 刘开强 1 ; 邓国富 1 ; 李丹婷 1 ;

作者机构: 1.广西农业科学院水稻研究所广西水稻遗传育种重点实验室

关键词: 水稻;红色种皮;全基因组关联分析;等位基因

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2017 年 14 卷 01 期

页码: 1-6

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 稻米种皮颜色可以分为白、红、黑等。在红色稻米种皮中富含原花青素,其具有抗氧化活性,有利于人体健康。本研究以419份广西地方稻种资源核心种质为实验材料,利用全基因组关联分析验证了控制水稻红色种皮的基因Rc。利用In Del标记HM1对97份红色种皮材料的DNA进行PCR,发现C323和C139属于第7外显子有14 bp缺失的红色种皮品种。然后,我们利用Sanger测序技术对这两个自然突变品种的Rc基因进行外显子测序,分析结果表明Rc ~(C139)和Rc ~(C323)属于2种不同的Rc等位基因类型。

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