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流感病毒M2质子通道抑制机理的计算化学模拟和理论分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谢能中 1 ; 杜奇石 2 ; 黄日波 3 ;

作者机构： 1.非粮生物质酶解国家重点实验室

2.国家非粮生物质能源工程技术研究中心

3.美国戈登生命科学研究所

关键词： 流感病毒;金刚烷;M2质子通道;抑制机理

期刊名称： 广西科学院学报

ISSN： 1002-7378

年卷期： 2014 年 04 期

页码： 289-293

摘要： 【背景】A型流感病毒的M2质子通道蛋白的X-ray和NMR结构已于2008年测定,并成为发展抗流感的重要药物靶标,但学术界对于抑制剂的作用机理尚有争论。【方法】用SYBYL软件作M2通道蛋白与金刚烷胺抑制剂的对接计算,在可能的对接位点(Asp-44,Trp-41,His-37)上用精确的量子化学方法计算对接能,并根据结构化学和物理化学的原理分析抑制剂的作用机理。【结果】计算了金刚烷胺与M2质子通道的多个可能的结合位点的结合能,包括His-37,Trp-41和Asp-44。【结论】金刚烷胺对M2的抑制是一个动态过程,可能有多个位点结合。金刚烷胺穿透细胞膜后在通道出口与Asp-44形成盐桥,质子流使盐桥解离,金刚烷胺再进入通道与芳香氨基酸Trp-41(或His-37)形成阳离子-键。

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