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木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因全长克隆

文献类型： 中文期刊

作者： 罗兴录 1 ; 陈会鲜 2 ;

作者机构： 1.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

2.亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室

关键词： 木薯;腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase);基因克隆;序列分析;基因全长

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2014 年 45 卷 07 期

页码： 1147-1153

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆木薯腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因cDNA全长序列,为木薯高淀粉品种的分子育种提供依据。【方法】根据木薯AGPase小亚基基因已知片段设计特异性引物,以木薯根、茎、叶为材料,利用PCR及RACE克隆木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列。运用生物信息学方法对其核苷酸序列和推导氨基酸的理化性质、蛋白质三级结构进行系统分析。【结果】克隆获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基cDNA全长1566bp,其中包括1566bp的完整ORF,编码一个含521个氨基酸的多肽。其理论蛋白质分子量57.01kDa,等电点6.1,呈酸性。多重序列比较分析结果显示,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基核苷酸序列与蓖麻、麻风树和杨树相应序列的相似性分别为87%、87%和86%。结合系统进化树分析结果推测,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基在不同物种及进化过程中具有高度的保守性。蛋白三级结构分析结果表明,木薯AGPase小亚基蛋白具有15个α-螺旋、24个β-折叠和多个转角。【结论】木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列与蓖麻、麻风树和杨树等具有较高的同源性。

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