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菠萝蜜响应低温胁迫的转录组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杜英俊 1 ; 朱鹏锦 1 ; 钟云婕 1 ; 唐秀观 1 ; 何江 1 ; 宋奇琦 1 ; 欧景莉 1 ; 叶维雁 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区亚热带作物研究所

关键词: 菠萝蜜;转录组;抗寒;基因;差异表达;光合作用

期刊名称: 中国南方果树

ISSN: 1007-1431

年卷期: 2023 年 52 卷 04 期

页码: 37-44+50

收录情况: 北大核心

摘要: 基于转录组研究抗寒性不同的菠萝蜜品系,筛选菠萝蜜抗寒关键基因,为菠萝蜜抗寒改良和耐寒良种选育提供参考。以自然低温胁迫后广西本地菠萝蜜抗寒品系、泰国引进的低温敏感型菠萝蜜品系为材料,结合田间表型持续观测,并运用转录组测序技术从分子水平上对2个不同抗寒特性菠萝蜜品系进行生物信息学分析。结果表明,两个品系共有差异表达基因30 585个,上调17 083个,下调13 502个。GO功能富集分析发现,差异表达基因显著富集在光合作用的光捕获、光反应、光合作用的调节,光强度反应,光系统、光系统I、光系统II,叶绿素、NADH、色素结合功能,以及类黄酮、类胡萝卜素、萜类等次生代谢物的代谢过程。KEGG途径富集分析发现,光合作用相关途径、淀粉与蔗糖代谢途径、植物激素信号转导途径及MAPK信号通路为菠萝蜜响应低温胁迫的重要代谢途径。差异表达基因注释到WRKY、ERF、bHLH、NAC、MYB等家族转录因子,与植物应答低温胁迫密切相关,可能参与菠萝蜜应答低温胁迫。

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