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野生型工业酿酒酵母Miseq测序方法的建立

文献类型： 中文期刊

作者： 张穗生 1 ; 罗贞贞 2 ; 黄日波 3 ;

作者机构： 1.广西科学院广西生物炼制重点实验室

2.非粮生物质酶解国家重点实验室

3.国家非粮生物质能源工程技术研究中心

关键词： 酿酒酵母;野生型工业菌株;Miseq;基因组测序方法;文库质量

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2014 年 33 卷 03 期

页码： 655-660

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 新一代测序方法在基因组学研究应用日趋广泛,已经成为工业酿酒酵母菌株基因组学研究的重要技术平台,但对工业酿酒酵母新一代测序技术方法缺乏详细报道。Miseq是小型新一代基因组测序仪,本文报道我们自建的野生型工业酿酒酵母基因组Miseq测序方法。该方法包括:制备分离a型和α型交配型的单倍体菌株、采用电泳和分光光度法方法监控基因组文库建立、优化上机文库浓度后测序。其中电泳和分光光度法方法为首创的文库质量监控简易方法,质控检测得到酿酒酵母工业菌株测序条件为:菌株的基因组文库DNA片段大小为250~850 bp且主要集中在350~550 bp,文库浓度范围为7~13 ng/μL;上机测序文库的优化浓度为20 pM。

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