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粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建

文献类型: 中文期刊

作者: 黄悦悦 1 ; 阳海宁 1 ; 郑加兴 2 ; 马增凤 2 ; 刘驰 2 ; 黄大辉 2 ; 张月雄 2 ; 李孝琼 1 ; 黄金艳 2 ; 李容柏 1 ;

作者机构: 1.广西大学生命科学与技术学院

2.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

关键词: 普通野生稻;粳稻;单片段代换系;标记辅助选择;多态性

期刊名称: 广西农业科学

ISSN: 1002-8161

年卷期: 2010 年 41 卷 04 期

页码: 297-302

摘要: 以粳稻日本晴(O.sativa L.subsp.Japonica cv.Nipponbare)为受体和轮回亲本,以广西普通野生稻核心种质DP15为供体,通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体(Single segment substitution lines,SSSLs)。用覆盖水稻全基因组的563对SSR引物检测供体(DP15)和受体(日本晴)的多态性,从中挑选212对分布在水稻12条染色体上的多态性引物跟踪供体基因型。结果表明,在BC3F1代获得79个代换片段,这些片段基本上能相互重叠并覆盖水稻12条染色体,其中第1、第2条染色体含有的代换片段数最多,均为9个,第9、第10和第12条染色体含有的代换片段数最少且均为5个。79个代换片段长度为12.65~113.55 cM,平均长度为54.3 cM,总覆盖长度为4285.28cM,是水稻整个染色体组长度的2倍多,覆盖野生稻全基因组达98.89%。随机选取其中的6个代换株系用96个多态性引物检测其遗传背景,发现供体DNA残留率为7.3%~15.6%。今后将继续通过回交和标记辅助选择,以获得一整套覆盖普通野生稻全基因组的SSSL库,这将有助于研究稻种的起源、演变和分化以及普通野生稻的功能基因组。

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