科研产出
基于完全型SSR标记的西番莲(Passiflora edulis)遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要:为了明确38份西番莲种质的亲缘关系,本研究利用11对完全型SSR标记对2份野生种和36份栽培种西番莲进行遗传多样性分析。结果表明,11对SSR标记共检测到37个等位基因,每对分子标记检测到的等位基因数为2~4个,平均数为3.37个;预期杂合度(He)为0.32~0.76,平均数为0.53;实际杂合度(Ho)为0.00~0.46,平均数为0.34;PIC为0.26~0.70,平均数为0.46。在遗传相似系数为0.67处,38份西番莲可分为8个类群,说明广西种植的西番莲种质遗传多样性丰富。本研究为栽培种西番莲新品种选育和分子遗传连锁图谱的构建提供了帮助。
关键词: 西番莲(Passiflora edulis) 完全型SSR 遗传多样性
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栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记。为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定,获得13 104个完全型SSR。SSR核心序列结构主要为2~4个碱基,数量最多的为TA、AT、TC和AG,重复次数最高达到20次。利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记,并选取了其中20对标记在西番莲MTX与WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达60%。西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持。
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