科研产出
石斛兰杂交后代iPBS标记鉴定及遗传分析
《中国农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为获取性状优良的子代单株用于后续新品种培育和优质亲本的选配，采用iPBS与形态学双标记鉴定方法，对‘粉条纹’石斛（母本）与‘丹绒之星’石斛（父本）杂交组合进行遗传鉴定研究。结果表明：iPBS标记鉴定36个子代植株均为真杂种，在遗传距离0.71处，亲本及36个子代可分为3大类群，子代先与父本聚为一类再与母本聚合，两亲本与子代的遗传相似系数父本（0.686 1）>母本（0.510 5）；形态学鉴定显示两亲本在各个性状上均存在较大差异，子代假鳞茎高度均值为25.48 cm，假鳞茎直径1.14 cm，叶片长度14.17 cm，叶片宽度3.45 cm，子代株型与叶型大小主要介于双亲间；子代花横径均值为4.96 cm，花纵径均值为5.75 cm，两者优于双亲的比例分别为16.67%和2.78%，多数子代植株花型较父母本偏小；在花部性状中，上萼宽、侧萼长宽和侧瓣长4个性状表现出一定超亲优势，唇瓣长和花梗数2个性状展现出较强的中亲优势，其余性状均呈现出不同程度的衰退趋势；子代在花色遗传上以父本的白紫色系为主，并在双亲花色色谱基础上展现梯度变化。综上，iPBS分子标记可有效提高鉴定石斛兰杂种的效率，形态学标记鉴定有助于高效选育性状优良的子代个体，2种标记方法均可有效缩短石斛兰杂交育种进程。
关键词： 石斛兰 子代鉴定 表型性状 iPBS标记 遗传表现
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石斛兰新品种‘旭日’
《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：‘旭日’石斛兰是以曲茎石斛（Dendrobium flexicaule）为母本，细茎石斛（Den. moniliforme）为父本杂交育成的新品种。株高中等，假鳞茎具紫色斑点，花朵浅黄色，唇瓣中部有橙红色胼胝体。具有较强的耐热性和适应性，适于华南地区温室或户外附生栽培。
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基于SLAF-seq技术的石斛兰SNP标记开发及亲缘关系分析
《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：利用SNP标记技术对收集的石斛兰种质资源进行亲缘关系分析,为新品种选育亲本选择提供理论依据.以 60 份石斛兰种质资源为对象,用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对种质进行SNP标记开发及亲缘关系分析.通过对各样品的测序数据进行统计,共获得 157.34 Mb Clean Reads数据,各样本Reads数据在 576 195-5 359 710 之间.样本平均测序质量值Q30为 93.85%,平均GC含量为 40.16%.通过测序数据分析,共获得 1 337 217 个SLAF标签,标签的平均测序深度为 9.63×,其中具多态性的SLAF标签有1 049 638个.共开发得到11 248 186个群体SNP标记,每个样品的SNP 标记数目介于694 015-6 367 379之间,SNP标记完整度为 2.71%-24.89%,杂合率为 1.13%-5.74%.对群体SNP 过滤,共获得 31 499 个高度一致性的有效SNP 标记.利用筛选获得的SNP标记构建系统发育树,60 份石斛兰种质资源被分为 3 个亚群,这 3 个亚群分别包含材料为 Q1:3 份,Q2:21份,Q3:36 份.种质聚类结果与形态学分类结果基本一致.利用SLAF-seq技术能高效、精确地开发出适用于石斛兰种质遗传分析的SNP标记,开发的SNP标记可为石斛兰育种、遗传图谱构建、品种鉴定以及农艺性状的关联分析等研究提供分子基础.
关键词： 石斛兰 SLAF-seq SLAF标签 SNP标记 群体结构 发育树 亲缘关系 遗传分析
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基于iPBS标记的石斛兰杂交子代真实性鉴定
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：石斛兰为石斛属所有植物的总称,是兰科植物中重要的花卉资源,具有极高的观赏和药用价值.杂交育种是培育石斛兰新品种的主要方法,但石斛兰的育种年限较长,整个育种周期通常需要几年的时间.种质资源的鉴定是育种工作的基础,本研究对石斛兰杂交后代株系进行鉴定,以期为石斛兰杂种后代的早期选择及新品种(系)的快速鉴定提供分子依据,进一步缩短育种周期,加快石斛兰育种工作进程.iPBS标记作为一种新型的分子标记,无需预先获取LTR序列,相较于其他分子标记具有简单、高效且应用范围广等优点,本研究采用iPBS分子标记技术对广美石斛×黄钻戒石斛的 19 个杂种 F1 株系进行杂种真实性鉴定,并进行遗传多样性和聚类分析.研究结果表明:从 83 条 iPBS引物中筛选出 7 条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物用于石斛兰杂交子代真实性鉴定;7 条引物共扩增出 69 条条带,其中多态性条带为 51 条,多态性比率为 73.91%;较多的父本遗传信息导入子代个体中,供试的 19 个杂种F1 株系均能扩增出父本特征性条带,鉴定为真杂种;聚类分析表明,绝大多数杂交后代在亲缘关系上先倾向于父本后倾向于母本;遗传相似系数分析结果表明,杂交后代与父本的平均遗传相似系数大于母本,说明供试杂交后代在遗传上更倾向于父本,与聚类结果吻合;该杂交组合子代植株偏父本遗传.研究结果证明,iPBS分子标记技术可作为石斛兰杂交育种早期杂交种筛选鉴定的有效方法.该研究结果为进一步揭示石斛兰种群亲本与子代间的遗传多样性提供科学依据.
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基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以48份石斛兰种质资源为对象,采用iPBS分子标记技术对其遗传多样性进行分析并构建DNA指纹图谱。结果表明:从83条iPBS引物中筛选出7条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物;利用筛选出的引物对48份石斛兰基因组DNA进行PCR扩增,共获得279条谱带,其中多态性条带279条,多态性比例为100%;采用GenAlEx6.5软件计算48份石斛兰的平均观测等位基因数（Na）为2.000,平均有效等位基因数（Ne）为1.202,平均Nei’s遗传多样性指数（He）为0.153,平均Shannon信息多样性指数（I）为0.274,48份石斛兰表现出丰富的遗传多样性;采用NTSYS-pc2.1软件计算得到48份石斛兰间的遗传相似系数为0.6667～0.9211,基于遗传相似系数进行UPGMA聚类,在相似系数0.75处,可将48份石斛兰划分为7个类群。利用2对引物构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出48份石斛兰种质资源,该图谱可为石斛兰分类与鉴定提供科学依据。
关键词： 石斛兰 iPBS分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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