科研产出
广西农家籼稻种质抗褐飞虱基因Bph40(t)的定位
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：褐飞虱是水稻生产危害中最严重的虫害之一，发掘水稻中抗褐飞虱的新基因并培育抗性品种是现今控制该虫害最有效的举措。广西农家种质——籼稻47-1连续3年的苗期、成株期对褐飞虱都表现一致高抗，遗传稳定性良好，具有明显的趋避性和抗生性，定位其抗性基因并探究其机理，对丰富抗褐飞虱基因的多样性和培育抗性水稻品种具有重大意义。本研究通过利用抗褐飞虱材料47-1与感褐飞虱材料9311杂交构建了包含91个单株的F2群体，采用虫体增重法进行褐飞虱抗性表型鉴定。结果显示F2群体抗性单株（虫体增重倍数≤1.1）与感性单株（虫体增重倍数＞1.1）的数量比为61∶30，卡方检验(χ~2=3.081＜χ0.01,1~2=3.84)表明该性状的分离比符合1对显性基因的分离规律。基因定位在第4染色体标记04M0.453与04M3.688之间的区域内检测到一个褐飞虱抗性位点，与克隆的Bph40定位区间重叠。序列分析表明，47-1中Bph40 （t）基因的CDS与已克隆的Bph40 CDS仅存在3个单碱基突变，共导致2个氨基酸差异，系统进化树分析发现两者的亲缘关系最近，表明该抗性基因就是Bph40的一个等位基因。
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广西特色香稻地方品种香味及其香味基因型的鉴定
《南方农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定广西地方香稻品种的香味及其香味基因型,为开发和利用广西香稻地方种质资源及选育优质特色香稻品种提供理论依据。【方法】将传统香味鉴定方法(KOH浸泡法和籽粒咀嚼法)与分子标记技术结合,对179份广西地方香稻种质资源的香味及其香味基因型进行鉴定。【结果】179份供试材料中,KOH浸泡法检测到具有香味的材料167份,籽粒咀嚼法检测到具有香味的材料124份。籽粒咀嚼法鉴定为香稻的品种中97.58%能用KOH浸泡法鉴定出香味,但KOH浸泡法鉴定为香稻的品种中仅72.46%能用籽粒咀嚼法鉴定出香味。利用分子标记法能检测到等位基因的有71份,占供试材料总数的39.66%,主要以InDel7和InDel4-5等位基因为主,其中仅1份检测到InDel2等位基因,40份检测到InDel7等位基因,37份检测到InDel4-5等位基因,未检测到InDel13等位基因,但有7份同时检测到InDel7等位基因和InDel4-5等位基因。71份能检测到等位基因的材料中有69份被籽粒咀嚼法和/或KOH浸泡法鉴定为香稻品种,正确率达97.18%。在籽粒咀嚼法和KOH浸泡法均鉴定为香稻的121个品种中,香味表型明确,但仅有55个品种能检测到等位基因,检出率为45.45%。来自百色市的供试材料中能检测到等位基因的品种占该市香稻品种总数的53.19%,含有InDel2、InDel7和InDel4-5等位基因型,但以Indel7等位基因型为主;来自河池市的供试材料中能检测到等位基因品种占该市香稻品种总数的比例最高,达64.10%,但只检测到2种基因型,以Indel4-5等位基因型为主;柳州市及其他市能检测到等位基因的比例远低于百色市和河池市。【结论】广西香稻地方品种具有较强的地域特色,不同地区的香稻香味等位基因存在明显差异,且可能存在已报道的等位基因之外的香味基因或香味等位基因,仅用4个已报道的等位基因不足以检测出全部的香稻品种,应将分子标记法与传统鉴定方法相结合,才可更准确鉴定出香稻品种。
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广西地方稻种资源核心种质红色种皮全基因组关联分析及鉴定两个新的Rc等位基因
《分子植物育种 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：稻米种皮颜色可以分为白、红、黑等。在红色稻米种皮中富含原花青素,其具有抗氧化活性,有利于人体健康。本研究以419份广西地方稻种资源核心种质为实验材料,利用全基因组关联分析验证了控制水稻红色种皮的基因Rc。利用In Del标记HM1对97份红色种皮材料的DNA进行PCR,发现C323和C139属于第7外显子有14 bp缺失的红色种皮品种。然后,我们利用Sanger测序技术对这两个自然突变品种的Rc基因进行外显子测序,分析结果表明Rc ~(C139)和Rc ~(C323)属于2种不同的Rc等位基因类型。
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广西普通野生稻Rf3和Rf4恢复基因位点的遗传多样性
《杂交水稻 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用与Rf3和Rf4紧密连锁的SSR标记RM10353和RM6100对106份广西普通野生稻核心种质材料的细胞质雄性不育恢复基因的等位性进行了分析。结果显示:在广西普通野生稻中,Rf3和Rf4座位各检测到6种类型的等位基因,等位基因频率分别在0.033 0～0.584 9和0.028 3～0.462 3之间,有效等位基因分别为2.488 6和3.444 5,Shanon’s信息指数分别为1.221 4和1.453 2。表明在广西普通野生稻中,Rf3和Rf4座位的遗传多样性很高。
关键词： 普通野生稻 恢复基因 Rf3 Rf4 等位基因 遗传多样性
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