基于SNP分子标记的广西玉米种质材料类群结构分析及核心种质构建

陈坤; 黄安霞; 周锦国; 卢生乔; 覃宏宇; 韦正乙; 弓雪; 刘亚利; 张述宽; 钟昌松; 《西南农业学报 》 2025 北大核心 CSCD

摘要：[目的]对广西玉米种质材料进行类群结构分析和核心种质构建,为广西玉米种质资源的高效利用、多样性保护及品种改良提供参考依据.[方法]利用SNP分子标记对523份具有重要育种价值的玉米种质材料进行遗传多样性分析,基于主成分判别分析(Discriminant analysis of principal components,DAPC)法、K-means聚类法和系谱关系分析材料的群体结构和遗传差异;采用模拟退火算法,在30.00%~10.00%取样范围内,以5.00%梯度取样比例逐级探索构建广西玉米核心种质.[结果]通过7888个SNP分子标记分析发现,523份玉米种质材料的基因多样性(Genetic diversity,GD)平均值为0.391,多态信息含量(Polymorphism in-formation content,PIC)平均值为0.309,遗传多样性总体上处于中度多态.基于DAPC法和K-means聚类法,可将523份玉米种质材料划分为4个类群,分别为Suwan群、墨黄群、Reid群和Non-Reid群,其遗传多态性排序为Suwan群<墨黄群

关键词： 玉米种质 遗传多样性 类群划分 SNP分子标记 核心种质