科研产出
169份不同遗传背景玉米自交系的遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】解析玉米自交系遗传多样性和群体遗传结构，为广西玉米育种实践提供理论参考。【方法】以169份不同遗传背景的玉米自交系为材料，以7份广西骨干自交系和3份我国其他地方的骨干自交系为对照，用10K SNP玉米芯片对其进行全基因组扫描，通过遗传相似度、系统进化、主成分和血缘同源确认（IBD）等分析其遗传多样性及群体遗传结构。【结果】筛选获得7565个高质量可用SNP分子标记，分布在10条染色体上，平均每条染色体上有756个，标记检出率均在97.12%以上，平均检出率达99.57%。174个玉米自交系的杂合率为0.21%～7.28%，平均为0.86%，有144个玉米自交系杂合率不高于1.00%，但有5个玉米自交系的杂合率偏高（31.29%～36.36%）。174份材料间的遗传相似度为0.486～0.999，平均为0.609，其中2个广西选育的西南骨干自交系B24(ZNC442)和CK＿D2（桂A10341）与其他材料间的遗传相似度平均值分别为0.642和0.629。由系统发育进化树可知，包含10个参考自交系在内的179个玉米自交系划分为Reid群和热带亚热带群两大类，其中Reid群含13个自交系，占比为7.26%，热带亚热带群含166个自交系，占比为92.74%。热带亚热带群又可细分为7个亚群，其中以Suwan群和CM群为主，分别含56和51个自交系，占比分别为31.28%和28.49%。主成分分析结果显示，PCA1v3中玉米自交系聚类情况与系统发育进化树聚类结果基本一致，能明显区分Reid群和热带亚热带群，且热带亚热带群中大多自交系分布在CM群和Suwan群参考自交系附近。IBD分群结果显示，Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别有21、47、64和47个。系统进化分析、主成分分析和IBD分群韦恩图显示，三者共属Reid群、Suwan群、CM群和A群的自交系数量分别为12、35、18和11个。【结论】广西玉米自交系来源复杂，遗传背景相似，不同分析方法的划分结果并不完全一致，需结合育种实践进行类群划分。广西选育的西南骨干玉米自交系ZNC442和桂A10341均属于A群，最理想组配模式为A群×Reid群，其次是A群×Suwan群和A群×CM群。
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基于SLAF-seq技术的石斛兰SNP标记开发及亲缘关系分析
《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：利用SNP标记技术对收集的石斛兰种质资源进行亲缘关系分析,为新品种选育亲本选择提供理论依据.以 60 份石斛兰种质资源为对象,用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对种质进行SNP标记开发及亲缘关系分析.通过对各样品的测序数据进行统计,共获得 157.34 Mb Clean Reads数据,各样本Reads数据在 576 195-5 359 710 之间.样本平均测序质量值Q30为 93.85%,平均GC含量为 40.16%.通过测序数据分析,共获得 1 337 217 个SLAF标签,标签的平均测序深度为 9.63×,其中具多态性的SLAF标签有1 049 638个.共开发得到11 248 186个群体SNP标记,每个样品的SNP 标记数目介于694 015-6 367 379之间,SNP标记完整度为 2.71%-24.89%,杂合率为 1.13%-5.74%.对群体SNP 过滤,共获得 31 499 个高度一致性的有效SNP 标记.利用筛选获得的SNP标记构建系统发育树,60 份石斛兰种质资源被分为 3 个亚群,这 3 个亚群分别包含材料为 Q1:3 份,Q2:21份,Q3:36 份.种质聚类结果与形态学分类结果基本一致.利用SLAF-seq技术能高效、精确地开发出适用于石斛兰种质遗传分析的SNP标记,开发的SNP标记可为石斛兰育种、遗传图谱构建、品种鉴定以及农艺性状的关联分析等研究提供分子基础.
关键词： 石斛兰 SLAF-seq SLAF标签 SNP标记 群体结构 发育树 亲缘关系 遗传分析
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罗汉果遗传多样性与群体结构及核心种质研究
《中草药 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的 分析罗汉果Siraitia grosvenorii种质遗传基础,以为其资源保护、品种改良和性状遗传结构解析提供依据.方法 采用SSR荧光分子标记对325份罗汉果及其近缘物种资源进行亲缘关系鉴定,并且进一步分析罗汉果遗传多样性、群体结构和构建其核心种质.结果 优选出的15对SSR荧光引物共检测到185个等位基因(平均为12.33个),平均香农信息指数(Shannon's information index,I)为 1.67,多态性信息含量指数(polymorphism information content,PIC)≥0.54;325份种质亲缘关系聚类在遗传距离0.95附近被划分为赤瓟、翅子罗汉果和罗汉果3个亚群,其中罗汉果亚群发现大量几乎无遗传差异个体,共鉴别获得140份具遗传差异的罗汉果初级核心种质.这些初级核心种质遗传分化系数(genetic differentiation coefficient,FST)为0.140,群体间、群体内、个体内遗传变异分别占总变异的14.0%、19.0%和67.0%,野生、地方和栽培种平均遗传距离分别为0.802 1、0.576 8、0.422 0,I分别为1.798、1.092、0.603;Jaccard遗传距离聚类分析在遗传距离0.8处被划分为9个亚群,群体结构和主成分分析均被划分为4个亚群.通过10%~70%比例随机抽样法,构建了 32份核心种质,其采集地点占原始种质的94.12%,等位基因数与原始种质的符合率为96.13%,I值为1.944 9.结论 优选出的15对SSR荧光引物多态性高,能有效鉴别罗汉果及其近缘物种赤瓟、翅子罗汉果.罗汉果初级核心种质存在中等程度遗传分化,遗传变异主要来自群体与个体内部,野生种与地方种遗传多样性高,栽培种遗传多样性低,存在4个明显基因库.构建的32份核心种质能充分代表原始种质地理来源与遗传多样性.
关键词： 罗汉果 SSR荧光标记 遗传多样性 群体结构 核心种质
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不同施氮水平对良丰优339群体结构、产量和氮素利用率的影响
《南方农业学报 》 2013 CSCD
摘要：【目的】研究不同施氮水平对杂交水稻品种良丰优339群体结构、产量及氮素利用率的影响,为良丰优339栽培调控和群体控制提供依据。【方法】采用随机区组设计,设6个不同氮肥施用量处理(0、90、135、180、225、270kg/ha),调查良丰优339茎蘖动态变化、产量及其结构因子和氮素利用率。【结果】施氮量为90和135 kg/ha时对茎蘖动态控制较合理,氮肥偏生产力(NPFP)、氮素农学利用率(NAE)、氮素生理利用率(NPE)和氮素吸收利用率(NAE)均达到较高水平。在较低施氮水平下,有效穗数随施氮水平的提高而显著增加;在较高施氮水平下,结实率随着施氮水平提高而下降。【结论】良丰优339在低氮条件下即可获得良好的群体结构、产量和较高的氮素利用率,其适宜施氮量为90～135 kg/ha。
关键词： 杂交水稻 良丰优339 不同施氮量 产量 群体结构 氮素利用率
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不同密肥条件对超级稻珞优8号的影响
《南方农业学报 》 2011 CSCD
摘要：【目的】研究不同密肥生态条件下超级稻珞优8号的生长及高产群体的结构特征,为超级稻的栽培调控和群体控制提供理论依据。【方法】2010年早季,以超级稻珞优8号为材料,进行4个抛栽密度48万株/h(aA)1、60万株/h(aA)2、72万株/ha(A3)、84万株/ha(A)4和2个施氮水平150kg/ha(B)1、225kg/ha(B)2试验,生长期内调查超级稻茎蘖动态,并进行干物质测定及成熟期穗粒结构调查等。【结果】超级稻珞优8号在不同施肥量及不同种植密度条件下,表现出一定的产量差异,以抛栽密度48万株/ha(A)1、施氮水平150kg/ha(B)1组合的综合效益最佳。【结论】生产中,通过适宜抛栽密度、合理施用氮肥和采用"好气灌溉"调节水分是超级稻获得高产的重要调控途径。
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氮肥运筹方式对桂两优2号生长发育及产量的影响
《耕作与栽培 》 2011
摘要：以超级稻桂两优2号为材料,研究不同氮肥运筹方式对群体茎蘖、叶面积动态、物质生产及产量的影响。结果表明,在施氮量不变的前提下,基肥占比重大的处理(A1、A2)在抽穗前生长旺盛,LAI值大、干物质积累多,但后期LAI值小、干物质积累少,产量低;穗肥占比重大的处理(A4、A5)前期生长慢、积累少,后期生长快、积累多,产量高。在5种氮肥运筹方式中,A4处理(基肥、分蘖肥、穗肥比率为4∶3∶3)产量最高,比A1处理(基肥、分蘖肥、穗肥比率为7∶3∶0)增产10.7%,达显著水平。
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