科研产出
巴马火麻性别相关的SRAP和SCAR分子标记
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究以巴马火麻为试验材料，采用SRAP分子标记技术，筛选与巴马火麻性别相关或连锁的特异条带。结果显示，引物ISSR839在巴马火麻雌雄单株之间存在较好多态性且条带清晰。因此，利用ISSR839引物检测雌雄单株之间的遗传稳定性，用于构建极端雌雄DNA池。此外，560对SRAP引物组合中24对引物在雌雄DNA池间能扩增出差异条带，其中引物对me11/em12在雄性DNA池中能稳定的扩增出一条1 431 bp的特异条带，而相应的雌性DNA池未能扩增出此条带。为了将此特异条带转化为稳定的SCAR标记，基于me11/em12引物对的基础，分别向5'和3'端延伸了2～3个碱基，获得SCAR标记的特异引物HXF/HXR，该引物经火麻雌雄单株验证。结果显示，雄性单株能扩增出唯一的1 436 bp条带，命名为SCAR-1436，而相应的雌性单株未能扩增此条带。该特异片段经克隆测序与比对，在NCBI上未找到与该片段同源的序列。本研究结果可为苗期的火麻植株进行雌雄性别鉴定，合理控制雌雄植株比例，提高火麻籽产量提供技术手段。
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利用SCAR分子标记鉴别香菇双单杂交后代
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SCAR分子标记鉴别香菇双单杂交后代，为香菇分子辅助育种提供技术支撑。【方法】通过ISSR分析获得标识供体亲本菌株YX7两个细胞核的特异性条带，根据特异性条带序列设计SCAR引物，对菌株YX7为供体和菌株808孢子单核体为受体杂交获得的40个杂交菌株进行SCAR-PCR鉴别，并采用传统镜检和拮抗测试方法进行验证。【结果】筛选出分别标识供体菌株YX7两个细胞核核型的特异性条带a和b，据此设计的SCAR引物PA和PB分别对供体菌株YX7的2个不同细胞核具有特异性扩增作用。SCAR-PCR鉴定结果显示，40个待测菌株中，27个菌株为杂合子，其中19个菌株具有a条带标识核型，8个菌株具有b条带标识核型；13个菌株为非杂合子，其中11个菌株同时具有条带a和b标识的两个核型，是菌株YX7本身，另外2个菌株两种核型均未被检测出，属于菌株808的孢子单核体。传统方法验证结果与SCAR分子标记鉴定结果完全一致。与传统方法相比，SCAR标记方法更简便高效、结果更稳定可靠，并可通过核型标识进一步将杂合子分为两组。【结论】SCAR分子标记能高效、全面和精准鉴别香菇双单杂交菌株的杂合子和非杂合子，可应用于香菇杂交分子辅助育种和遗传分析。
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罗汉果性别相关的SCAR标记筛选
《北方园艺 》 2019 北大核心
摘要：以罗汉果雌雄单株各30份为试材,采用随机引物筛选法,筛选与罗汉果性别相关的RAPD标记,并根据特异片段的测序结果,将RAPD标记转化为特异性和稳定性更好的SCAR标记,以期为罗汉果的性别早期鉴定和分子辅助育种研究提供参考依据。结果表明:在330条随机引物中获得了分别与罗汉果雌性和雄性相关的RAPD引物S2124和S343。根据特异序列测序结果,对雌性特异带S2124-1K和雄性特异带S343-1.4K各自设计并合成了2对SCAR引物,经验证,SCAR引物SC2124-1K-14在62℃和SC2124-1K-8在56℃均可扩增出1 019bp的雌性特异带,SC343-1.4K-12在64℃和SC343-1.4K-4在56℃均可扩增出1 373bp的雄性特异带。这些特异的SCAR标记具有较好的应用价值,可为罗汉果的性别早期鉴定提供分子依据。
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苦瓜抗白粉病SCAR分子标记的开发
《南方农业学报 》 2013 CSCD
摘要：【目的】获得与苦瓜抗白粉病基因紧密连锁的分子标记,为加快苦瓜抗白粉病新品种的选育奠定基础。【方法】以高抗白粉病野生苦瓜MC18为父本、高感白粉病苦瓜栽培种MC1-2为母本创建F2代分离群体;经单株抗病性鉴定后,以BSA法构建F2代单株的高抗和高感白粉病苦瓜DNA近等基因池;利用SRAP技术筛选多态扩增片段,对仅在抗白粉病近等基因池和父本中出现的差异片段进行回收、测序、比对和转化成SCAR标记,并利用已知抗病性的单株DNA分析标记与苦瓜抗白粉病的相关性。【结果】从1188对SRAP引物组合中筛选到稳定阳性差异条带的引物组合5对,其中ME20EM5引物对扩增的差异条带长度为332 bp,与葡萄抗体蛋白基因(抗性基因)的DNA序列有较高相似性,并将其成功转化成与苦瓜白粉病抗性相关、大小为320 bp的SCAR标记。【结论】开发的SCAR-ME20EM5分子标记可用于苦瓜抗白粉病分子标记辅助选择。
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