科研产出
巴马火麻性别相关的SRAP和SCAR分子标记
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究以巴马火麻为试验材料，采用SRAP分子标记技术，筛选与巴马火麻性别相关或连锁的特异条带。结果显示，引物ISSR839在巴马火麻雌雄单株之间存在较好多态性且条带清晰。因此，利用ISSR839引物检测雌雄单株之间的遗传稳定性，用于构建极端雌雄DNA池。此外，560对SRAP引物组合中24对引物在雌雄DNA池间能扩增出差异条带，其中引物对me11/em12在雄性DNA池中能稳定的扩增出一条1 431 bp的特异条带，而相应的雌性DNA池未能扩增出此条带。为了将此特异条带转化为稳定的SCAR标记，基于me11/em12引物对的基础，分别向5'和3'端延伸了2～3个碱基，获得SCAR标记的特异引物HXF/HXR，该引物经火麻雌雄单株验证。结果显示，雄性单株能扩增出唯一的1 436 bp条带，命名为SCAR-1436，而相应的雌性单株未能扩增此条带。该特异片段经克隆测序与比对，在NCBI上未找到与该片段同源的序列。本研究结果可为苗期的火麻植株进行雌雄性别鉴定，合理控制雌雄植株比例，提高火麻籽产量提供技术手段。
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CDDP结合SRAP标记分析杧果品种的遗传多样性
《中国南方果树 》 2022 北大核心
摘要：应用CDDP和SRAP分子标记技术对35个杧果品种进行遗传多样性分析，统计遗传多样性信息数据，并进行聚类分析和主成分分析。结果表明，12条CDDP引物和12对SRAP引物组合分别扩增得到条带263条和243条。其中多态性条带数分别为250条和230条，多态性条带比率分别为95.45%和94.61%,有效等位基因数分别为1.59和1.62,Nei’s基因多样性分别为0.32和0.24,Shannon信息指数分别为0.55和0.46,多态性信息含量分别为0.60和0.59,遗传相似系数变化范围分别为0.64～0.96和0.64～0.92,平均遗传相似系数分别为0.80和0.78,CDDP结合SRAP标记遗传相似系数变化范围为0.62～0.94,平均遗传相似系数为0.78。CDDP标记、SRAP标记以及CDDP结合SRAP标记分别在遗传相似系数为0.709 5、0.694 7以及0.685 0处可以将35个杧果品种分别分为3类、3类和5类，说明两种标记结合分析能够更加详细地解释杧果品种间的亲缘关系。而主成分分析结果和聚类分析结果有相似之处，但也有很大不同。
关键词： 杧果 CDDP SRAP 聚类分析 主成分分析 遗传相似系数
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广西野生桃金娘亲缘关系的SRAP分析
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为弄清广西桃金娘资源的亲缘关系并发掘其优异种性,进行驯化或为将来选育种提供优异亲本材料。本研究采用SRAP技术对8份野生桃金娘种质进行亲缘关系分析,从99对SRAP引物中筛选出18对多态性好、分辨率高的引物。结果显示,18对引物共获得142条带,其中多态性位点107个,多态条带比率为75.35%,表明不同桃金娘种质基因型间存在着较丰富的遗传多样性;8份桃金娘种质的相似系数在0.680 0～0.795 0之间。在相似系数0.720 3处可将8份种质分为3大类群:类群1包括岑溪、昭平、容县;类群2包括北海、龙州小连城、桂林;类群3包括龙州大青山和龙州彬桥。试验材料中亲缘关系最近的是龙州大青山与龙州彬桥,亲缘关系最远的是桂林与岑溪。研究表明,SRAP分子标记可有效地应用于桃金娘种质亲缘关系研究,结果可为桃金娘种质的资源保存鉴定、亲本选配和遗传改良提供理论依据。
关键词： 桃金娘（Rhodomyrtus tomentosa） SRAP 亲缘关系
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利用正交设计优化茄子的SRAP体系
《农业研究与应用 》 2017
摘要：以Solanum melongena自交系01为试验材料,利用正交设计L16(45)在5因素4水平上对茄子SRAP反应体系稳定性的Mg~(2+)、d NTPs、引物、Taq酶及模板DNA等外部条件进行了优化试验,并对所稳定的体系进行验证。得出最佳的体系的引物的浓度为0.4 mmol/L、d NTPs的浓度为0.2 mmol/L、Mg~(2+)浓度为2.0 mmol/L、模板DNA为40 ng、Taq酶浓度为0.25U/μL。
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SRAP分子标记分析糯玉米自交系的遗传多样性
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用SRAP分子标记技术对46个糯玉米自交系进行遗传多样性研究及杂种优势群划分。结果表明:46个糯玉米自交系可分为9个类群,分析结果与这些自交系综合性状的差异性表现基本一致。参照部分糯玉米自交系进行的配合力测试结果来看,高产组合的双亲基本都在不同的类群,而类内杂交较难产生优良的杂交组合,这也从实践角度说明SRAP标记技术对糯玉米杂种优势群的划分是合理可信的。
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苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较
《南方农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：[目的]优化苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系,比较这两种分子标记在苦瓜应用中的优劣,为苦瓜突变体筛选提供参考.[方法]以8份苦瓜种质为材料,对AFLP和SRAP反应体系中各反应因素浓度进行筛选优化;分别选取5对条带清晰、重复性好的AFLP和SRAP引物对8份苦瓜材料进行扩增,比较其多态性.[结果]在AFLP反应体系中,在0-10倍稀释范围内,以连接产物稀释5倍时反应效果较好;将预扩产物稀释30倍进行选择性扩增为宜.在SRAP反应体系中,Mg^2+浓度为2.5mmol/L、dNTP浓度为0.2mmol/L时,反应效果较好.多态性分析结果显示,5对AFLP引物共扩增出145条带,多态性条带有18条,多态性比率为12.41%;5对SRAP引物扩增条带数为109条,其中多态性条带数有9条,多态性比率为8.25%.[结论]AFLP和SRAP两种分子标记技术均可以很好反映苦瓜种质资源的遗传多样性,但AFLP扩增产物的平均多态性高于SRAP,能够比较稳定地筛选出差异条带.
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苦瓜抗白粉病SCAR分子标记的开发
《南方农业学报 》 2013 CSCD
摘要：【目的】获得与苦瓜抗白粉病基因紧密连锁的分子标记,为加快苦瓜抗白粉病新品种的选育奠定基础。【方法】以高抗白粉病野生苦瓜MC18为父本、高感白粉病苦瓜栽培种MC1-2为母本创建F2代分离群体;经单株抗病性鉴定后,以BSA法构建F2代单株的高抗和高感白粉病苦瓜DNA近等基因池;利用SRAP技术筛选多态扩增片段,对仅在抗白粉病近等基因池和父本中出现的差异片段进行回收、测序、比对和转化成SCAR标记,并利用已知抗病性的单株DNA分析标记与苦瓜抗白粉病的相关性。【结果】从1188对SRAP引物组合中筛选到稳定阳性差异条带的引物组合5对,其中ME20EM5引物对扩增的差异条带长度为332 bp,与葡萄抗体蛋白基因(抗性基因)的DNA序列有较高相似性,并将其成功转化成与苦瓜白粉病抗性相关、大小为320 bp的SCAR标记。【结论】开发的SCAR-ME20EM5分子标记可用于苦瓜抗白粉病分子标记辅助选择。
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不同耐寒甘蔗品种的SRAP标记分析
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：采用100对SRAP引物对35个不同耐寒甘蔗品种进行了标记,并筛选出了72对多态性较好的SRAP引物进行了遗传多样性分析。结果表明72对引物共扩增出1241条谱带,平均每对引物扩增出17.2条谱带,其中多态性条带为89.36%。品种间的遗传相似系数在0.5773～0.7264之间,平均为0.6340。聚类分析表明,35份甘蔗品种可分为5个类群,聚类分析结果不能反映供试材料的地域特性;同时,耐寒性相对较好的品种分散于4个类群中,说明聚类分析并不能把耐寒性好的品种聚成一类;而两三个耐寒性较差的品种能够聚在一起,说明SRAP标记对耐寒性较差的品种的聚类起到较好的作用。SRAP标记在甘蔗耐寒性研究上起到一定的参考作用。
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斑茅割手密杂种后代真实性鉴定及遗传分析
《作物学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：以斑茅GXA87-36(♀)与割手密GXS79-9(♂)杂交获得的经形态鉴别为真杂种的后代材料GXAS07-6-1(斑茅割手密杂合体)及其双亲为材料,利用体细胞染色体计数以及SSR、SRAP分子标记对杂种进行真实性鉴定,并利用SRAP分子标记对斑茅GXA87-36、割手密GXS79-9及其杂种后代遗传位点的传递进行分析。结果表明,GXA87-36体细胞染色体数为2n=60,GXS79-9体细胞染色体数为2n=64,其杂种GXAS07-6-1染色体2n=62,其杂交的染色体遗传方式为n+n;筛选出3对SSR引物和5对SRAP引物可分辨后代的真伪;利用71对SRAP引物扩增后代和双亲,检测到1095个遗传位点,多态性位点数为800;母本有279个位点,其中有79%传递给其后代;父本有439个位点,其中有73%传递给后代;用NTSYS-pc2.10e软件计算Jaccard遗传相似系数,双亲间为0.474,后代与母本、父本间分别为0.696、0.752,表明后代GXAS07-6-1偏向父本遗传。
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