科研产出
苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系优化及应用比较
《南方农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：[目的]优化苦瓜AFLP和SRAP的PCR反应体系,比较这两种分子标记在苦瓜应用中的优劣,为苦瓜突变体筛选提供参考.[方法]以8份苦瓜种质为材料,对AFLP和SRAP反应体系中各反应因素浓度进行筛选优化;分别选取5对条带清晰、重复性好的AFLP和SRAP引物对8份苦瓜材料进行扩增,比较其多态性.[结果]在AFLP反应体系中,在0-10倍稀释范围内,以连接产物稀释5倍时反应效果较好;将预扩产物稀释30倍进行选择性扩增为宜.在SRAP反应体系中,Mg^2+浓度为2.5mmol/L、dNTP浓度为0.2mmol/L时,反应效果较好.多态性分析结果显示,5对AFLP引物共扩增出145条带,多态性条带有18条,多态性比率为12.41%;5对SRAP引物扩增条带数为109条,其中多态性条带数有9条,多态性比率为8.25%.[结论]AFLP和SRAP两种分子标记技术均可以很好反映苦瓜种质资源的遗传多样性,但AFLP扩增产物的平均多态性高于SRAP,能够比较稳定地筛选出差异条带.
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广西沼泽型水牛血清蛋白多态性的研究
《中国畜牧兽医 》 2011 北大核心
摘要：本研究采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对193头广西西林水牛和196头广西富钟水牛的血清运铁蛋白、白蛋白和淀粉酶的基因型、基因型频率及遗传变异系数进行分析,探讨这两个品种的遗传背景。结果表明,西林水牛和富钟水牛运铁蛋白(Tf)受TfA和TfD两个等位基因控制,基因频率TfD>TfA,以TfD为优势基因,DD为优势基因型;西林水牛和富钟水牛的白蛋白(Alb)受AlbA和AlbX两个等位基因控制,基因频率为AlbX>AlbA,以AlbX为优势基因,西林水牛以XX为优势基因型,而富钟水牛以AX为优势基因型;富钟水牛血清淀粉酶(Amy)存在AA、AB、BB、BC、AC、CC 6种基因型,受AmyA、AmyB、AmyC 3个等位基因控制,在AmyⅠ、AmyⅡ中都是以AmyA为优势基因,分别以AB和BC为优势基因型。本研究结果发现,3种血清蛋白在西林水牛和富钟水牛中不存在性别差异(P>0.05),提示广西这两个优良地方水牛品种的遗传稳定性较好。
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粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建
《广西农业科学 》 2010
摘要：以粳稻日本晴(O.sativa L.subsp.Japonica cv.Nipponbare)为受体和轮回亲本,以广西普通野生稻核心种质DP15为供体,通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体(Single segment substitution lines,SSSLs)。用覆盖水稻全基因组的563对SSR引物检测供体(DP15)和受体(日本晴)的多态性,从中挑选212对分布在水稻12条染色体上的多态性引物跟踪供体基因型。结果表明,在BC3F1代获得79个代换片段,这些片段基本上能相互重叠并覆盖水稻12条染色体,其中第1、第2条染色体含有的代换片段数最多,均为9个,第9、第10和第12条染色体含有的代换片段数最少且均为5个。79个代换片段长度为12.65～113.55 cM,平均长度为54.3 cM,总覆盖长度为4285.28cM,是水稻整个染色体组长度的2倍多,覆盖野生稻全基因组达98.89%。随机选取其中的6个代换株系用96个多态性引物检测其遗传背景,发现供体DNA残留率为7.3%～15.6%。今后将继续通过回交和标记辅助选择,以获得一整套覆盖普通野生稻全基因组的SSSL库,这将有助于研究稻种的起源、演变和分化以及普通野生稻的功能基因组。
关键词： 普通野生稻 粳稻 单片段代换系 标记辅助选择 多态性
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利用SSR标记分析栽培种花生多态性及亲缘关系(英文)
《作物学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：利用 1 1对SSR引物对 2 4个花生栽培品种 (包括四大类型 )进行PCR扩增分析 ,其中 4对检测到明显的多态性 ,共检测到 3 3个等位基因变异 ,每一个位点上检测到的等位变异数为 5～ 1 3个 ,平均为 8.2 5个。根据扩增结果可以将 2 4个品种中的 2 1个相互区分。供试品种间的遗传相似系数值为 0 .2～ 1 .0 ,平均为 0 .4 788。根据UPGMA聚类分析结果 ,供试品种大多数按亚种聚为两大类群 (Ⅰ、Ⅱ ) ;在两大类群下 ,大多数品种也基本上按类型分类。本研究结果表明 ,SSR在分析栽培种花生DNA多态性和遗传关系方面非常有用
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利用SSR标记分析栽培种花生多态性及亲缘关系
《花生学报 》 2003
摘要：利用11对SSR引物对24个栽培种花生品种(包括四大类型)进行PCR扩增分析,其中4对检测到明显的多态性,共检测到33个等位基因变异,每一个位点上检测到的等位变异数为5~13个,平均为8.25个。根据扩增结果可以将24个品种中的21个相互区分。供试品种间的遗传相似系数值在0.2~1.0之间,平均为0.4788。根据UPGMA聚类分析结果显示:供试品种大多数按亚种聚为两大类群(Ⅰ、Ⅱ);在两大类群下,大多数品种也基本上按类型分类。本研究结果表明,SSR在分析栽培种花生DNA多态性和遗传关系方面非常有用。
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