科研产出
罗汉果性别相关的SCAR标记筛选
《北方园艺 》 2019 北大核心
摘要：以罗汉果雌雄单株各30份为试材,采用随机引物筛选法,筛选与罗汉果性别相关的RAPD标记,并根据特异片段的测序结果,将RAPD标记转化为特异性和稳定性更好的SCAR标记,以期为罗汉果的性别早期鉴定和分子辅助育种研究提供参考依据。结果表明:在330条随机引物中获得了分别与罗汉果雌性和雄性相关的RAPD引物S2124和S343。根据特异序列测序结果,对雌性特异带S2124-1K和雄性特异带S343-1.4K各自设计并合成了2对SCAR引物,经验证,SCAR引物SC2124-1K-14在62℃和SC2124-1K-8在56℃均可扩增出1 019bp的雌性特异带,SC343-1.4K-12在64℃和SC343-1.4K-4在56℃均可扩增出1 373bp的雄性特异带。这些特异的SCAR标记具有较好的应用价值,可为罗汉果的性别早期鉴定提供分子依据。
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广西甘蔗鞭黑粉菌遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析广西甘蔗主产区甘蔗鞭黑粉菌遗传多样性水平,为研究病菌毒力变化及甘蔗病害综合治理提供新思路。【方法】从广西各甘蔗主要产区采集甘蔗鞭黑粉菌样品,提取其中70份单倍体菌株基因组DNA,使用优化的随机扩增多态性DNA标记(RAPD)反应体系和经筛选获得的RAPD引物进行PCR扩增,电泳谱带使用NTSYS2.1进行聚类分析,并构建系统发育进化树。【结果】使用筛选出的10个RAPD引物进行扩增,获得77条条带,每个引物扩增得到的条带数为4~11条,大小为150~3000 bp,包含6个多态性位点,群体多态位点百分率为7.79%。70个甘蔗鞭黑粉菌的相似系数为0.96~1.00,在0.96的遗传系数上菌株可分为两大类,其中类群1聚集了来自横县校椅镇的两个菌株,其余68个菌株分布在类群Ⅱ中。【结论】广西甘蔗鞭黑粉菌遗传分化度较低,片段多态性和菌株地理来源、寄主和交配型无显著相关性。
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24个荸荠品种遗传多样性RAPD分析
《南方农业学报 》 2012 CSCD
摘要：【目的】从分子水平上了解不同地区荸荠地方品种的亲缘关系及遗传多样性,为荸荠品种资源研究和选育提供理论依据。【方法】利用RAPD分子标记技术,对24个不同地区荸荠地方品种进行遗传多样性及聚类分析。【结果】从100条RAPD引物筛选出条带清晰、多态性理想的引物15条,共扩增出83条清晰带,其中多态性带为61条,多态性比例为73.5%。24个荸荠地方品种间的遗传距离为0.0976～0.6757,平均为0.3048;UPGMA聚类分析可将24份荸荠品种分为5组,其中第4组又可分为两个亚组,野生荸荠单独归为一亚组。【结论】24份荸荠品种的遗传基础相对较狭窄,亲缘关系较近,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异性。
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基于RAPD分析的中国苏铁属部分种类亲缘关系探讨
《广西植物 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用21个筛选出来的RAPD引物,对苏铁属21个种的22份材料进行分析,获得333个RAPD标记,利用NTSYS(V.2.10e)软件,建立了22份供试材料的UPGMA聚类图,进而探讨了苏铁属21个种类间的亲缘关系。RAPD聚类分析结合形态学研究结果表明:多裂苏铁和叉孢苏铁的亲缘关系很近,聚为一类,多裂苏铁应为叉孢苏铁的一个亚种。西林苏铁、隆林苏铁、叉孢苏铁、尖尾苏铁、叉叶苏铁、长柄叉叶苏铁、多羽叉叶苏铁、长球果苏铁、贵州苏铁、四川苏铁、短叶苏铁、石山苏铁、宽叶苏铁、十万大山苏铁、元江苏铁、仙湖苏铁、海南苏铁、台湾苏铁、广东苏铁、滇南苏铁相互间的亲缘关系均较远,支持各自为独立的种。
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基于RAPD-PCR标记的印度亚麻品种遗传多样性和指纹图谱分析(英文)
《广西农业科学 》 2010
摘要：栽培的亚麻(L.usitatissimum)通常为亚麻籽,以其油分和纤维而被认为是具有较高经济价值的作物之一。开发亚麻遗传资源并进一步进行遗传改良,须了解其遗传变异的范围和结构。位于坎普尔的C.S.农业科技大学种质管理单位保存有广泛收集而来的2772份栽培和野生亚麻资源。从中选出23份不同基因型栽培亚麻品种包括5份两用品种、4份种用品种、14份具有不同形态和经济特性的引进种用品种以及1份野生品系(L.grandiflorum),采用RAPD标记进行遗传多样性分析。20条随机引物共产生242条带,每条引物扩增带数为1～20条,平均为10.95条。所有基因型和位点的RAPD多态性比例为90.49%。DICE系数相似矩阵分析揭示其遗传相似性为0.63～0.97,平均相似系数为82%,说明这些亚麻品种(系)的遗传背景较窄。采用UPGMA法以及NTSYS-pc软件的SAHN聚类分析模型对遗传相似矩阵进行聚类分析,发现属于L.uitatisimums的所有栽培品种在X轴上可聚为一类,而L.grandiflorum野生种单独在Y轴上聚为一类。主成分分析结果表明,除了Shekha(r优良种用品种)和野生种L.grandiflorum广泛分布外,其他所有种用品种、两用品种和外来品种聚类很近。由于亚麻栽培品种的遗传关系相近,须对亚麻种质的各种基因型进行鉴定,以拓宽今后育种计划中的遗传基础。
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苏铁属植物RAPD反应体系的优化及部分种类亲缘关系的探索(英文)
《广西植物 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：通过优化苏铁属植物的RAPD反应体系,进而探讨苏铁属部分种类的亲缘关系。结果表明,Mg~(2+)、dNTP、Taq酶及随机引物浓度在RAPD反应中有重要影响,而模板DNA浓度有一个很大的适应范围。适合苏铁属植物RAPD分析的反应体系:20μL反应体系中,含有10 mmol/L Tris-HCl(pH8.3)、50 mmol/L KCl、2.0mmol/L MgCl_2、200μmol/L dNTP、0.3μmol/L随机引物、模板DNA 50ng、Taq酶1.0 U。聚类分析结果基本反应了苏铁属各个种间的亲缘关系,证明了RAPD适用于苏铁属种间亲缘关系分析。RAPD聚类分析结合形态学研究表明:海南苏铁、台湾苏铁、广东苏铁、滇南苏铁和仙湖苏铁之间的亲缘关系较远,支持各自成为独立的种。
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荸荠基因组DNA的提取及RAPD反应体系的建立(英文)
《广西农业科学 》 2009
摘要：以荸荠叶状茎为试验材料,采用改良的SDS法提取其基因组DNA,并对其RAPD反应体系进行优化,建立了荸荠的RAPD-PCR优化反应体系和程序。结果表明,提取的基因组DNA纯度和完整性较好,OD260/OD280值在1.8～2.0之间,DNA无降解现象,完全可以满足RAPD-PCR扩增要求。建立了荸荠RAPD反应体系:总体积为25μl,各有关成分的最佳浓度分别为25mmol/L Mg2+,1.0U Taq DNA聚合酶,0.2mmol/L dNTPs,1μmol/μl引物,1.5ng/μl DNA模板。PCR反应程序为:94℃预变性3min;94℃变性1min,37℃退火30s,72℃延伸60s,40个循环;最后72℃延伸10min。
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罗汉果性别的RAPD标记研究
《中药材 》 2006 北大核心 CSCD
摘要：采用随机扩增多态性DNA(Random Amp lified Polymorph ism DNA,RAPD)技术,运用集群分离分析法(Bu lked SegregantAnalysis,BSA)研究与罗汉果性别连锁的分子标记。从90条随机引物的扩增产物中筛选出18条可能与性别连锁的RAPD标记。利用雌雄个体对这18条RAPD标记进行验证,发现引物S1431所扩增的约400bp谱带在8个雌性单株中都不出现,而在8个雄性单株中都出现,表明这是一条与雄性连锁的RAPD标记。
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