基于SSR荧光标记的杧果种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

唐玉娟; 罗世杏; 黄国弟; 宋恩亮; 李日旺; 赵英; 张宇; 莫永龙; 唐莹莹; 《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：丰富的种质资源是杧果新品种选育和产业发展的基础.为保护和利用杧果种质资源,本研究利用课题组前期开发的 TP-M13-SSR 标记对杧果种质资源保护广西创新基地圃内保存的 145 份杧果地方品种、育成品种及其近缘野生种进行遗传多样性分析和分子身份证构建.结果表明:12 对引物的平均观测等位基因数为 3.2838、平均观察杂合度(Ho)为 0.5858、平均期望杂合度(He)为 0.6725、平均Shannon指数(I)为 1.3383、平均Nei基因多样性指数(Na)为 0.6702、多态信息含量(PIC)分布范围在 0.5036~0.7827 之间,平均值为 0.6396,所有引物为高度多态性位点,说明TP-M13-SSR荧光引物可以为杧果的遗传多样性分析提供研究数据;145 份材料的遗传相似性系数变化范围为 0.5676~1.000,平均为0.7417,其中爱文与印度杧 1 号遗传相似性系数为 1.000,扁桃杧田阳 20-2 与大头香杧、扁桃杧田阳 20-2 与硕帅杧、金煌杧与桂热杧 10-1 的遗传相似性系数最小,均为 0.5676;在遗传相似性系数为 0.7060 时,145 份种质分为 2 个类群,I类群包括 108 份杧果和 20 份扁桃,种质数量最多,占总数的 88.9%,Ⅱ类群包括 17 份材料,全部为扁桃.在遗传相似性系数为 0.7330 时,I类群可进一步分为 5 个亚群,其中I-1 和I-3 亚群种质数量最多,占所有杧果的 91.92%,UPGMA聚类分析表明扁桃未严格按照种属关系聚在一起,杧果的整体聚类结果与其地理来源基本一致;对 145 份材料的扩增产物进行SSR荧光标记毛细管电泳检测获得指纹图谱,采用数字和字母相结合的编码方式获得分子身份证,通过分子身份证进行种质鉴定,每一对引物可平均区分 12.4 份种质,鉴定率明显高于前人研究,表明TP-M13-SSR检测技术比目前广泛采用的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测技术在杧果种质鉴定上更具优势.本研究结果为杧果及其近缘种种质资源的收集整理和新品种的选育提供科学依据.

关键词： 杧果 TP-M13-SSR 遗传多样性 分子身份证