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茶树12个酚类物质合成途径关键酶SSR分子标记的开发及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 彭靖茹 1 ; 檀业维 1 ; 温立香 1 ; 张芬 1 ; 黄寿辉 1 ; 陈家献 1 ; 袁冬寅 1 ; 赵媛 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区亚热带作物研究所南宁530002

关键词: 茶树;SSR标记;酚类合成酶;遗传多样性;核心种质

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2022 年 30 卷 005 期

页码: 825-836

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 茶多酚是茶树(Camellia sinensis)的主要次级代谢产物,与茶树的新陈代谢、生长发育及品质非常密切.茶树酚类物质的合成涉及多种酶.目前针对茶树酚类合成途径特定酶开发的SSR分子标记引物及应用还较少.本研究基于茶树全基因组序列,以茶树酚类物质合成途径12个关键酶的基因及其侧翼序列开发获得了158对SSR分子标记引物,其中类黄酮3'-羟化酶开发获得的SSR引物最多,有29对,肉桂酸羟化酶最少,只有1对.所开发的158对SSR引物,位于基因间隔区的最多,依次是内含子区、上游区及外显子区,位于5′端上游非编码区的最少.这些引物总计有122个重复单元,其中二核苷酸最多,之后依次为三核苷酸、四核苷酸及五核苷酸,最少的是六核苷酸.从158对SSR引物中挑选68对进行了引物多态性筛选,将获得的13对多态性好的引物开展72份茶树种质资源遗传多样性的研究,共获得105种带型,同一样品的重复样可聚在一起,表明所筛选的引物能很好地区分种质资源,具有较好的准确性.72份茶树种质资源的遗传相似系数为0.8120~0.9849.本研究为茶树基于主要内含物酚类物质开展核心种质构建、新品种选育及品种鉴定等提供依据,同时也可为针对特定基因开发SSR分子标记提供参考方法.

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