科研产出
基于ISSR分子标记的金花菌遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于ISSR分子标记对不同地理来源的金花菌进行遗传多样性分析,为金花菌菌种资源的分类鉴定、评价及挖掘利用提供科学依据.[方法]利用ISSR分子标记对湖南益阳、陕西咸阳、广西横州和广西梧州4个不同地理来源的61株金花菌菌株进行遗传多样性分析;使用NSYSpc 2.10e计算不同菌株之间的遗传相似系数并进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,使用PopGene 1.32计算遗传多样性相关参数.[结果]使用11条ISSR引物共扩增获得168个位点,其中多态性位点158个,多态性比例为94.0%.UPGMA聚类分析结果显示,61株金花菌菌株之间的遗传相似系数在0.48~1.00;当遗传相似系数为0.60时,61株金花菌菌株被分为5个类群,类群Ⅰ为冠突曲霉(Aspergillus cristatus),类群Ⅱ为谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri),类群Ⅲ为假灰绿曲霉(Aspergillus pseudoglaucus),类群Ⅳ为Aspergillus cibarius,类群Ⅴ为赤曲霉(Aspergillus ruber).4个地理群体的Nei's遗传一致度在0.7409~0.9967,平均值为0.8607;遗传距离在0.0033~0.3000,平均值为0.1560;其中,陕西咸阳群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最小,Nei's遗传一致度最高,而广西梧州群体与湖南益阳群体之间的遗传距离最大,Nei's遗传一致度最低.61株金花菌菌株的平均Nei's基因多样性指数(H')为0.2622,平均Shannon's信息指数(I)为0.4082,群体间遗传分化系数为0.4228,群体基因流值为0.6825.[结论]金花菌菌株具有丰富的遗传多样性,ISSR类群划分与金花菌菌种分类具有一定关联,同一菌种的遗传多样性与地理来源之间不存在明显的相关性.
关键词： 金花菌 曲霉属 冠突曲霉 ISSR分子标记 遗传多样性
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基于ISSR标记的广西桄榔种质资源遗传多样性及亲缘关系分析
《经济林研究 》 2024 北大核心
摘要：【目的】为桄榔种质资源的保护和可持续开发利用提供参考。【方法】采用试剂盒方法，选择健康、新鲜、表现良好的嫩叶，提取广西18个桄榔居群的201份样品基因组DNA，通过ISSR分子标记技术，利用10条清晰明亮、多态性好的ISSR引物对桄榔样品基因组DNA进行PCR扩增。使用POPGENE32软件计算引物的多态性指标，用NTSYS软件中的UPGMA法构建居群间的聚类图，分析评价广西桄榔种质资源遗传多样性与亲缘关系。【结果】10条引物共扩增出150个位点，所有位点均具有多态性，多态性比率为100%，等位基因数量平均值为1.552 2，有效等位基因数量平均值为1.278 6,Shannon’s遗传多样性信息指数平均值为0.257 8,Nei’s基因多样性指数平均值为0.168 1。弄岗居群具有最高的遗传多样性（Nei’s基因多样性指数为0.214 4），南宁市人民公园居群的遗传多样性最低（Nei’s基因多样性指数为0.104 7）。201份供试样本的遗传相似性系数为0.833 8～0.983 2，平均值为0.916 2。其中，崇左市天等县居群与南宁市人民公园居群之间遗传相似性系数最低，遗传差异性最大，亲缘关系最远；龙州县水口镇居群与龙州县武德乡居群之间遗传相似性系数最大，遗传差异性最小，亲缘关系最近。聚类分析结果显示，在遗传相似性系数为0.928时，可将18个居群分成5个类群。【结论】广西桄榔遗传多样性水平较高，ISSR分子标记在桄榔种质间有丰富的多态性，能较好地揭示桄榔居群间的亲缘关系，适用于桄榔遗传多样性研究。
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睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR分子标记技术对从国内外引种的46份睡莲种质资源进行遗传多样性分析,并对其中的原生种及原生变种构建DNA指纹图谱,旨在阐明其亲缘关系基础上,为睡莲分类鉴定、杂交育种、功能基因的挖掘和利用及图位克隆等提供理论依据。结果表明:从100条ISSR引物中筛选出10条多态性高、重复性好的引物,在46份睡莲种质资源中共扩增出281条带,平均每条引物扩增条带数为28.1条,多态性条带281条,多态性比例为100%;平均Shannon信息指数(Ⅰ)为0.4197,平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.2657,平均有效等位基因数(N)1.4139,表现出丰富的遗传多样性;遗传相似系数值在0.51～0.98之间,基于遗传相似系数建立了聚类树状图,揭示了46份睡莲种质资源的亲缘关系,并在相似系数水平为0.68时,可将所有供试材料聚为6类。对总计24个睡莲原生种及原生变种构建了DNA指纹图谱,依据图谱差异可鉴定不同的睡莲种质。
关键词： 睡莲种质资源 ISSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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24份古荔枝种质资源ISSR遗传多样性分析（英文）
《南方农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】了解广西古荔枝种质资源的遗传多样性及其亲缘关系,为其种质资源利用和品种选育等提供参考。【方法】采用ISSR分子标记技术对24份古荔枝种质资源的遗传多性及亲缘关系进行分析。【结果】从100条ISSR引物中筛选出13条带形清晰、重复性好的引物,共扩增出96条条带,其中有43条为多态性条带,多态性比例为44.79%,平均每条引物扩增的条带数为7.4条。供试古荔枝种质资源间的遗传相似系数范围为0.43~1.00,平均相对遗传相似系数为0.61。UPGMA法聚类分析结果表明,在遗传相似系为0.66处供试的24份古荔枝种质资源被分为三大类群。类群Ⅰ均来自广西灵山县,类群Ⅱ来自广西桂平市、北流市、玉林市、灵山县和大新县,类群Ⅲ来自广西北流市和灵山县。【结论】24个广西古荔枝品种资源间的遗传基础宽,可作为今后荔枝杂交选育的优良种质资源。
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荸荠种质资源品种遗传多样性ISSR分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为揭示不同荸荠栽培品种的遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对24个荸荠品种的亲缘关系进行分析。结果表明,从100条ISSR引物中筛选出适合荸荠种质分析的11条ISSR引物,共扩增出86条带,平均每条引物扩增出7.8条带,多态性为69条带,多态性比例为80.3%。供试的24份荸荠品种两两之间的遗传距离值在0.0909-0.6071之间,平均值为0.3493。UPGMA法聚类结果表明24个荸荠品种在遗传距离0.34处可分为五类。24个荸荠品种在ISSR分析中亲缘关系较近,其遗传基础相对较狭窄,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异。
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13个大果油茶品种遗传与亲缘关系的ISSR分析
《南方农业学报 》 2013 CSCD
摘要：【目的】探讨广西大果油茶资源的遗传多样性及其亲缘关系,为其种质资源利用和品种选育等提供参考。【方法】采用ISSR分子标记技术对13个大果油茶品种(系)的遗传与亲缘关系进行分析。【结果】从99条ISSR引物中筛选出6条多态性引物,共扩增出56条带,其中54条为多态性带,多态性比例为95.2%,平均每个引物扩增的条带数为9.33条。供试大果油茶品种间的遗传相似系数范围为0.2222~0.7826,平均相对遗传相似系数为0.5293。UPGMA法聚类分析结果表明,供试的13个大果油茶品种(系)可分为3个类群。UPGMA法聚类分析结果表明供试的13个大果油茶品种(系)可分为3个类群。【结论】13个广西大果油茶品种资源间的遗传基础较宽。
关键词： 大果油茶 ISSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 广西
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20份兰科植物的ISSR遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：采用ISSR分子标记技术对20份兰科植物品种资源的遗传多样性和亲缘关系进行分析。结果表明,从100条ISSR引物中共筛选出6条多态性稳定清晰的引物,对20份兰科植物材料总共扩增出616条带,平均每个引物扩增出102.7条带,其多态性为100%。兰科植物的遗传多样性非常丰富。利用非加权平均距离法(UPGMA)构建系统树聚类分析,在相似系数0.32和0.38处,20份兰科植物品种资源被细分为4类,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ类,分别属于石斛属、兜兰属、毛兰属和兰属。根据聚类的树状图分析20份兰科植物的亲缘关系,其中亲缘关系最近的是兰属与毛兰属,亲缘关系较近的是兰属与兜兰属,亲缘关系最远是兰属与石斛属。
关键词： 兰科 品种资源 ISSR分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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利用ISSR分子标记分析香蕉品种的遗传多样性
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR分子标记技术对威廉斯B6及其选育亲本等国内外32个香蕉品种(系)的遗传多态性进行分析。从98对通用ISSR引物中筛选出7对多态性引物,共扩增出64条DNA带,其中51条为多态性带,多态性比例为79.69%,平均每个引物扩增的DNA带数为9.12条。供试香蕉品种间的遗传相异系数范围为0.0345～0.7500,平均相对遗传相异系数为0.03051。聚类分析结果表明,所有供试的32个香蕉品种(系)可分为四个类群,其中巴引103、野酸蕉和花蕉(观赏)分别为一类,其余29个品种(系)聚为一类。
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