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基于ISSR标记的广西桄榔种质资源遗传多样性及亲缘关系分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨海霞 1 ; 兰秀 1 ; 李恒锐 1 ; 梁振华 1 ; 马仙花 1 ; 韦婉羚 1 ; 黄珍玲 1 ; 陈会鲜 1 ;

作者机构: 1.广西南亚热带农业科学研究所

关键词: 桄榔;ISSR分子标记;遗传多样性;聚类分析

期刊名称: 经济林研究

ISSN: 1003-8981

年卷期: 2024 年 42 卷 004 期

页码: 41-50

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】为桄榔种质资源的保护和可持续开发利用提供参考。【方法】采用试剂盒方法,选择健康、新鲜、表现良好的嫩叶,提取广西18个桄榔居群的201份样品基因组DNA,通过ISSR分子标记技术,利用10条清晰明亮、多态性好的ISSR引物对桄榔样品基因组DNA进行PCR扩增。使用POPGENE32软件计算引物的多态性指标,用NTSYS软件中的UPGMA法构建居群间的聚类图,分析评价广西桄榔种质资源遗传多样性与亲缘关系。【结果】10条引物共扩增出150个位点,所有位点均具有多态性,多态性比率为100%,等位基因数量平均值为1.552 2,有效等位基因数量平均值为1.278 6,Shannon’s遗传多样性信息指数平均值为0.257 8,Nei’s基因多样性指数平均值为0.168 1。弄岗居群具有最高的遗传多样性(Nei’s基因多样性指数为0.214 4),南宁市人民公园居群的遗传多样性最低(Nei’s基因多样性指数为0.104 7)。201份供试样本的遗传相似性系数为0.833 8~0.983 2,平均值为0.916 2。其中,崇左市天等县居群与南宁市人民公园居群之间遗传相似性系数最低,遗传差异性最大,亲缘关系最远;龙州县水口镇居群与龙州县武德乡居群之间遗传相似性系数最大,遗传差异性最小,亲缘关系最近。聚类分析结果显示,在遗传相似性系数为0.928时,可将18个居群分成5个类群。【结论】广西桄榔遗传多样性水平较高,ISSR分子标记在桄榔种质间有丰富的多态性,能较好地揭示桄榔居群间的亲缘关系,适用于桄榔遗传多样性研究。

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