科研产出
茉莉花开放授粉系遗传多样性分析及亲缘关系鉴定
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了分析茉莉花开放授粉系遗传多样性及鉴定其亲缘关系，本研究以包含29份茉莉花开放授粉系的45份素馨属种质资源为材料，采用iPBS分子标记技术对其遗传多样性进行分析，并鉴定开放授粉系亲本。结果表明：(1)从50条iPBS引物中筛选出7条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物；(2)利用筛选出的引物对45份素馨属资源基因组DNA进行PCR扩增，获得129条清晰条带，其中多态性条带117条，多态性比率80%～100%，平均多态性比率89.87%;(3)采用NTSYS-pc 2.1软件计算45份素馨属资源的平均观测等位基因数(Na)为1.898 7，平均有效等位基因数(Ne)为1.207 4，平均Nei's遗传多样性指数(He)为0.152 3，平均Shannon信息多样性指数(I)为0.224 4,45份素馨属资源表现出丰富的遗传多样性；(4)采用NTSYS-pc 2.1软件计算45份素馨属资源间的遗传相似系数为0.247 3～0.968 8，基于遗传相似系数进行UPGMA聚类，构建系统发育进化树，在相似系数0.54处将45份素馨属资源划分为3个类群；(5)素馨属种间资源的基因交流少，遗传差异较大，茉莉花与素馨属其他种较难发生自然杂交，但通过种内开放授粉可拓宽茉莉花遗传背景；(6) iPBS分子标记多态性高，重复性好，便于操作，能有效进行茉莉花开放授粉系的遗传多样性分析，供素馨属资源的鉴定、亲缘关系分析和分子辅助育种参考应用。本研究为茉莉花种质资源的鉴定和杂交育种提供参考依据。
关键词： 茉莉花 素馨属 iPBS分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以48份石斛兰种质资源为对象,采用iPBS分子标记技术对其遗传多样性进行分析并构建DNA指纹图谱。结果表明:从83条iPBS引物中筛选出7条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物;利用筛选出的引物对48份石斛兰基因组DNA进行PCR扩增,共获得279条谱带,其中多态性条带279条,多态性比例为100%;采用GenAlEx6.5软件计算48份石斛兰的平均观测等位基因数（Na）为2.000,平均有效等位基因数（Ne）为1.202,平均Nei’s遗传多样性指数（He）为0.153,平均Shannon信息多样性指数（I）为0.274,48份石斛兰表现出丰富的遗传多样性;采用NTSYS-pc2.1软件计算得到48份石斛兰间的遗传相似系数为0.6667～0.9211,基于遗传相似系数进行UPGMA聚类,在相似系数0.75处,可将48份石斛兰划分为7个类群。利用2对引物构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出48份石斛兰种质资源,该图谱可为石斛兰分类与鉴定提供科学依据。
关键词： 石斛兰 iPBS分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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金花茶组植物种质资源遗传多样性的iPBS分析
《西南农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析24份金花茶组植物种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为金花茶组植物种质资源的鉴定和杂交育种提供参考依据.[方法]以毛瓣金花茶和夏石金花茶DNA样品进行引物筛选,从50条iPBS(Inter primer binding site)引物中筛选出稳定、清晰的引物对所有供试材料进行PCR扩增,利用非加权平均距离法(UPGMA)构建系统发育进化树,采用iPBS分子标记技术分析其遗传多样性.[结果]从50条iPBS引物中筛选出10条多态性高、重复性好的引物,在24份金花茶组植物种质资源中共扩增出280条条带,平均每条引物扩增条带数为28条,多态性条带268条,多态性比率为92.68%,平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon多样性信息指数(I)分别为1.9571、1.3544、0.2332和0.3767,表明金花茶组植物种质资源具有丰富的遗传多样性;24份金花茶组植物种质资源的遗传相似系数为0.543~0.836,在遗传相似系数0.680处,可将24份金花茶组植物种质资源聚为3组.[结论]iPBS分子标记多态性高,重复性好,便于操作,能有效进行金花茶组植物种质资源的遗传多样性分析,可供金花茶种质资源的品种鉴定、亲缘关系分析和分子辅助育种参考应用.
关键词： 金花茶组植物 种质资源 iPBS分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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