科研产出
短期免耕和垄作对稻田土壤微生物群落及多样性指数的影响
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：微生物群落和多样性指数是表征土壤质量好坏的关键指标。采用高通量测序手段,研究了4种耕作方式(常耕CT、免耕NT、垄作常耕RCT和垄作免耕RNT)下稻田土壤微生物群落及多样性指数的变化。结果表明:在门水平上,稻田土壤优势微生物有10种,分别为变形菌门、绿弯菌门、硝化螺杆菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、放线菌门、疣微菌门、浮霉菌门以及泉古菌门。其中变形菌门和绿弯菌门所占比例较大。与CT相比,NT、RCT和RNT降低了稻田土壤的泉古菌门和厚壁菌门比例、而提高了硝化螺杆菌门比例,其中以RCT降低或提高的作用最为明显。与CT相比,NT提高了稻田土壤微生物的Chao 1、PD whole tree、Observed species指数,而垄作(RCT、RNT)显著地提高了稻田土壤微生物的Chao 1、PD whole tree、Observed species指数,以RCT的作用最明显。耕作方式改变了稻田土壤微生物群落以及多样性指数,垄作有利于稻田土壤微生物向着多样化发展。
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华南瓜类疫霉的RAPD遗传多样性分析
《菌物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了解来自广东和广西的瓜类疫霉的遗传多样性,利用从180条RAPD引物中所筛选出的多态扩增性强、重复性好的12条引物,对分离自两省区的96株瓜类疫霉进行了全基因组DNA遗传多样性分析和指纹图谱构建。通过对供试菌株的RAPD-PCR扩增,共获得135条DNA标记谱带,其中124条为多态性谱带,多态检测率为91.9%。利用NTSYSpc Version2.1软件对供试菌株间的遗传距离进行聚类分析并构建系统树,以遗传相似系数0.81为阈值,将96个供试菌株划分为12个RAPD群,多数分离物之间遗传相似性较低,在DNA水平上存在显著的遗传变异,具有较丰富的遗传多样性。不同地区间菌株的遗传分化程度不同,分离自黄瓜的菌株遗传分化明显高于分离自冬瓜的菌株。RAPD群与菌株地理来源、分离寄主、致病力、交配型及甲霜灵抗性均无明显的相关性。
关键词： 瓜类疫霉 遗传多样性 RAPD分析 遗传距离 黄瓜 冬瓜
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甘薯种质资源形态标记遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：对广西保存的476份国内外不同甘薯种质资源的形态标记进行遗传多样性分析。结果表明:广西保存的甘薯种质资源存在较为丰富的遗传多样性,17个形态性状在不同甘薯种质材料间的平均变异系数为40.14%,平均多样性指数达到了0.6012;来源于广西的甘薯种质资源群体遗传多样性更为丰富,其平均多样性指数比整个群体平均值高88.24%;从国内三大薯区和国外甘薯种质资源群体划分来看,国外群体的平均变异系数最大,应更好地保护和加以利用;前9个主成分的累计贡献率达到了72.41%,它们代表了全部性状的绝大部分变异,可为甘薯新品种选育提供一定的参考依据。
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荸荠种质资源品种遗传多样性ISSR分析
《西南农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为揭示不同荸荠栽培品种的遗传多样性,利用ISSR分子标记技术对24个荸荠品种的亲缘关系进行分析。结果表明,从100条ISSR引物中筛选出适合荸荠种质分析的11条ISSR引物,共扩增出86条带,平均每条引物扩增出7.8条带,多态性为69条带,多态性比例为80.3%。供试的24份荸荠品种两两之间的遗传距离值在0.0909-0.6071之间,平均值为0.3493。UPGMA法聚类结果表明24个荸荠品种在遗传距离0.34处可分为五类。24个荸荠品种在ISSR分析中亲缘关系较近,其遗传基础相对较狭窄,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异。
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菜心种质资源遗传多样性的SCoT分析
《南方农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SCo T标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据。【方法】搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCo T引物对其进行遗传多样性分析。【结果】12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63%~57.89%,平均多态性百分率为36.00%;每条引物多态性条带变化范围为4~9条,平均3.4条;扩增片段大小为500~1500 bp。观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon’s信息多样性指数(I)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei’s遗传距离为0.428。AMOVA分析发现,81%的变异来源于品种内,19%的变异来源于品种间。聚类分析结果表明,在Nei’s遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种。【结论】SCo T标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCo T标记归类;SCo T标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测。
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SCoT分子标记技术在木薯遗传多样性分析中的应用
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：应用SCo T标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带6.5条,多态性条带比率为71.9%。经NTSYS-pc2.10e软件计算分析,28份木薯种质间遗传相似系数在0.631~0.930之间。利用UPGMA法进行聚类的结果显示:在系数0.68处,木薯材料分为2大类,品种BRA354单独成为一类;在系数为0.734处,28份木薯种质资源主要聚为5大类,聚类结果与材料来源有一定相关性。SCo T标记能在木薯种质间检测出一定程度的遗传多样性,可为木薯遗传育种提供新的技术支持。
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广西桑树细菌性枯萎病菌致病力和遗传多样性分析
《基因组学与应用生物学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：从广西9个县市采集具有典型枯萎症状桑树样品和发病田块土壤样品,经分离纯化获得致病性菌株105株。依据在桑树品种桂桑优12的致病性强弱,将广西桑树细菌性枯萎病菌株分为强致病力(57株)、中等致病力(17株)和弱致病力(31株)三种致病型。对48个代表性致病菌株进行16S rDNA和rpoB基因序列测定,同源性分析和系统进化树分析结果显示,这48个菌株分别为阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae(16株)、阿氏肠杆菌(E.asburise)(13株)、桑肠杆菌(E.mori)(7株)、产酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytoca)(3株)以及未确定种的肠杆菌属(Enterobacter sp.)3株、克雷伯氏菌属(Klebsiella sp.)6株。阿氏肠杆菌和阴沟肠杆菌出现的频率最高,是广西的优势菌株。研究结果表明,广西桑树细菌性枯萎病菌具有丰富的遗传多样性。
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SCoT分子标记技术在丝瓜上的应用
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】采用SCo T分子标记技术分析丝瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为丝瓜种质资源的利用和品种选育提供参考。【方法】采用80条引物和SCo T-PCR对81份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在优化的SCo T-PCR反应体系基础上,从80条引物中筛选获得10条多态性丰富、重复性好的引物,每条引物扩增获得10~17条100~2100 bp的条带;10条引物共扩增获得140条带,其中多态性条带124条,多态性比例87.57%。81份丝瓜种质材料的遗传相似系数在0.5900~0.9200,在0.5900处可将所有供试材料划分为两大类,第Ⅰ类包括46份有棱丝瓜材料,第Ⅱ类包括35份普通丝瓜材料,广西和广东的丝瓜种质材料主要聚在第Ⅰ类。在遗传相似系数0.7200和0.7900处,第Ⅰ、Ⅱ大类丝瓜材料均可划分为5个组,每组丝瓜材料主要来自相同地区。【结论】SCo T分子标记可作为ISSR、SRAP等标记的有效补充,为丝瓜种质资源的研究提供简单、可靠的工具。
关键词： 丝瓜 种质资源 遗传多样性 亲缘关系 SCoT分子标记技术
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苦瓜枯萎病菌的鉴定及其遗传多样性分析
《植物病理学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：对分离获得的32株苦瓜枯萎病菌菌株进行形态学特征和寄主专化型测定,结果表明,测试的苦瓜枯萎病菌株均为尖孢镰刀菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.momordicae),这些菌株可以侵染苦瓜和瓠瓜幼苗,但不侵染其他葫芦科瓜类作物。对苦瓜枯萎病菌菌株的rDNA-ITS区(ITS1、5.8S和ITS2)序列进行扩增测序,结果显示其序列长度均为456bp;聚类分析表明测序菌株与镰刀菌属中尖孢镰刀菌不同专化型的菌株聚为一群。利用RAPD标记技术分析苦瓜枯萎病菌的遗传多样性,结果显示苦瓜枯萎病菌株与其他葫芦科瓜类作物枯萎病菌株间的遗传相似系数范围为0.59~0.99,当遗传相似系数为0.85时,供试的48个菌株分成10个类群(G1~10)。在RAPD聚类树中所有苦瓜枯萎病菌株聚在一个分支上(G1群),菌株间的遗传相似系数范围为0.92~1.00,具有较高的遗传相似性,且菌株的聚群与地理来源存在一定的相关性。
关键词： 尖孢镰刀菌苦瓜专化型 rDNA-ITS RAPD-PCR 遗传多样性
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