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资源类型: 中文期刊
关键词:聚类分析(模糊匹配)
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266份木薯种质资源农艺性状分析评价

《热带作物学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:以木薯种质资源为对象,对其 8 个主要农艺性状数据进行统计学分析.结果表明:8 个农艺性状数据呈正态分布,变异系数范围为 7.2%~46.9%,其中淀粉产量的变异系数达 46.9%,薯干率的变异系数最小,为 7.2%.相关分析结果表明,不同性状之间存在一定的显著正相关,其中单株鲜薯质量与茎径呈极显著正相关.进一步利用主成分分析方法将 8 个农艺性状简化为 3 个主成分,发现 2 年的累计贡献率分别达 92.55%、93.67%.第一主成分是单株鲜薯质量、鲜薯产量、淀粉产量、薯干产量,第二主成分是淀粉含量和薯干率.通过聚类分析表明,在欧式距离为 6.0 处,可将各年份的资源分为 4 个类群,其中第Ⅱ类群(单株鲜薯质量、鲜薯产量、淀粉产量、薯干产量)表现优异,可优先作为高产优质木薯新品种选育的亲本材料.

关键词: 木薯 种质资源 农艺性状 相关性分析 主成分分析 聚类分析

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有棱丝瓜种质资源在华南地区夏植的适应性评价

《种子 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:为鉴定评价有棱丝瓜种质资源夏植的适应性,选育适宜在华南地区夏植的有棱丝瓜品种提供种质基础,本试验以广西玉林市夏植的44份有棱丝瓜种质资源为研究对象,分析各种质夏植中主要农艺性状,并对种质资源的11个主要农艺性状进行主成分分析、相关性分析、聚类分析等综合评价。结果表明,44个有棱丝瓜种质资源在夏植过程中主要农艺性状的表现差异较大。变异系数以单次采收产量折合产量变异较丰富,多样性指数以第一成瓜节位为最高。相关性分析发现,重要性状单次采收折合产量与全生育期长短和单瓜重呈极显著正相关,而与播种至始收天数和瓜花斑大小呈极显著负相关,与第一成瓜节位呈显著负相关。主成分分析将原有11个农艺性状指标转化为4个综合因素指标,累积贡献率达71.987%。通过聚类分析,将供试材料分为四大类群,其中第Ⅰ类群包括31份种质,属中低产类型;第Ⅱ类群包含1份种质,属晚熟高产类型;第Ⅲ类群包含1份种质,属长生育期高感霜霉病低产类型;第Ⅳ类群包括11份种质,属早熟高产类型。通过农艺性状综合对比分析,筛选出越夏产量表现较佳的5份种质:LCH8、LCH2、LCH4、LCH14、LCH25,适宜作为华南地区夏植品种选育的种质资源。

关键词: 有棱丝瓜 种质资源 夏植 聚类分析 适应性评价

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66个广西审定丝苗品种农艺和品质性状多样性鉴定与聚类分析

《中国稻米 》 2024

摘要:为了明确广西审定水稻丝苗品种的农艺和品质性状差异与趋同程度,选用2017—2023年广西审定的66个丝苗品种为材料,对18个主要农艺和品质性状进行鉴定、表型多样性分析和品种间聚类分析。结果表明,这66个品种农艺性状表型和品质性状多样性丰富;基于农艺性状表型和品质性状的品种间欧氏距离聚类,可分为5类,包含29个品种的类群农艺性状表型和品质性状表现趋同,此类群包含两系杂交稻品种、三系杂交稻品种和常规稻品种;两系杂交稻品种表型多样性最高,分布于各个类群中,常规稻最低,基本被聚在同一大类中。类群间农艺性状表型和品质性状差异明显,具有相同母本或相同父本的品种基本聚归同类,品种间欧氏距离短。育种组配间会出现亲缘关系较远、农艺和品质性状接近的趋同情况。结果可为广西丝苗型水稻品种的组配选育和推广应用提供理论支持。

关键词: 水稻 品种 农艺性状 多样性 聚类分析 广西

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基于ISSR标记的广西桄榔种质资源遗传多样性及亲缘关系分析

《经济林研究 》 2024 北大核心

摘要:【目的】为桄榔种质资源的保护和可持续开发利用提供参考。【方法】采用试剂盒方法,选择健康、新鲜、表现良好的嫩叶,提取广西18个桄榔居群的201份样品基因组DNA,通过ISSR分子标记技术,利用10条清晰明亮、多态性好的ISSR引物对桄榔样品基因组DNA进行PCR扩增。使用POPGENE32软件计算引物的多态性指标,用NTSYS软件中的UPGMA法构建居群间的聚类图,分析评价广西桄榔种质资源遗传多样性与亲缘关系。【结果】10条引物共扩增出150个位点,所有位点均具有多态性,多态性比率为100%,等位基因数量平均值为1.552 2,有效等位基因数量平均值为1.278 6,Shannon’s遗传多样性信息指数平均值为0.257 8,Nei’s基因多样性指数平均值为0.168 1。弄岗居群具有最高的遗传多样性(Nei’s基因多样性指数为0.214 4),南宁市人民公园居群的遗传多样性最低(Nei’s基因多样性指数为0.104 7)。201份供试样本的遗传相似性系数为0.833 8~0.983 2,平均值为0.916 2。其中,崇左市天等县居群与南宁市人民公园居群之间遗传相似性系数最低,遗传差异性最大,亲缘关系最远;龙州县水口镇居群与龙州县武德乡居群之间遗传相似性系数最大,遗传差异性最小,亲缘关系最近。聚类分析结果显示,在遗传相似性系数为0.928时,可将18个居群分成5个类群。【结论】广西桄榔遗传多样性水平较高,ISSR分子标记在桄榔种质间有丰富的多态性,能较好地揭示桄榔居群间的亲缘关系,适用于桄榔遗传多样性研究。

关键词: 桄榔 ISSR分子标记 遗传多样性 聚类分析

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19个广西审定丝苗型品种主要农艺性状与遗传多样性聚类分析

《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:为了明确广西审定丝苗型品种的趋同程度与遗传差异,选用19个广西审定丝苗品种,通过18个主要农艺性状表型鉴定与聚类分析,并采用48对SSR标记进行遗传多样性分析.结果表明:基于农艺性状表型的品种间欧氏距离聚类,可分为4类,包含12个品种的类群农艺性状表型表现趋同;3个两系品种,2个常规稻,14个三系品种均被聚类在不同的大类中,说明育种方式不影响表型聚类,农艺性状表型差异多样.基于SSR标记的遗传距离聚类,所有品种可以被划分为4个类群,而不同类群之间的遗传差异也显而易见,遗传多样性丰富;具有相同母本,或采用相同父本的品种,基本归于同类.两种聚类结果的对比表明,育种中品种间会出现遗传关系较远,农艺性状接近的情况;也会出现遗传关系较近,农艺性状相差较远的情况.研究农艺性状表型鉴定与聚类和解析遗传多样性的结果可为广西丝苗型品种的选育和推广保护提供理论和技术支持.

关键词: 农艺性状 SSR标记 遗传多样性 聚类分析

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广西割手密创新种质F1群体的表型多样性分析

《江苏农业科学 》 2024 北大核心

摘要:基于表型性状对60份广西割手密F1群体创新种质材料的遗传多样性进行分析,为广西割手密创新种质材料的利用提供理论依据,以60份含广西割手密87-16血缘F1群体创新种质为材料,通过变异分析、相关分析、主成分分析和聚类分析对其分蘖率、株高、茎径、锤度、有效茎数、单茎重、单产和糖产量等8个主要农艺性状进行遗传多样性分析。结果表明,该群体的8个农艺性状变异较丰富,变异系数在5.51%~36.36%之间,其中单茎重的变异系数最大,达到36.36%;相关性分析表明,单产与株高、茎径、有效茎数和单茎重呈极显著正相关,并与品质性状糖产量也呈极显著正相关;主成分分析表明,2个主成分累计贡献率为75.744%,第1主成分糖产量因子是重要因子,贡献率为52.063%;聚类分析结果表明,在欧氏距离为9.50处将60份创新材料分为5类,分类的5个类群都各具优势和不足,这些性状可以根据不同的甘蔗育种目标而进行充分的利用。其中第Ⅰ类群和第IV类群的8个性状指标均优异,共筛选出12份优质材料,分别是GXSF112-1、GXSF112-27、GXSF112-29、GXSF112-53、GXSF112-14、GXSF112-40、GXSF112-42、GXSF112-63、GXSF112-10、GXSF112-13、GXSF112-21、GXSF112-26,可以进一步作为亲本材料在甘蔗育种中加以利用,也可为割手密种质应用和品种选育提供理论参考。

关键词: 割手密 表型 遗传多样性 聚类分析

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自然低温下二十二个蝴蝶兰品种的抗寒性评价

《北方园艺 》 2024 北大核心

摘要:以引进的22个蝴蝶兰品种为试材,采用主成分分析法、隶属函数分析法和聚类分析法,研究了不同蝴蝶兰在自然低温胁迫后相对电导率(REC)、丙二醛(MDA)、过氧化氢酶(CAT)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、可溶性蛋白质(SP)、可溶性糖(SS)、脯氨酸(Pro)、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)等9个抗寒性生理指标的变化,以期为蝴蝶兰抗寒种质挖掘及抗寒性评价提供参考依据。结果表明:22个蝴蝶兰品种中丙二醛、过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、过氧化物酶、可溶性蛋白质、可溶性糖、脯氨酸、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶等8个指标差异显著。主成分分析发现,前4个主成分的累积贡献率为73.706%,解释了大部分抗寒性指标的信息。以综合抗寒能力D值进行聚类分析可将22个蝴蝶兰品种划分成5类,其中抗寒性最强的品种是‘版纳’‘罗氏’‘西蕾丽’,抗寒性最差的是‘蓝星’‘紫钻’‘香妃’。

关键词: 蝴蝶兰 抗寒性 主成分分析 隶属函数分析 聚类分析

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71份广西豌豆地方种质资源农艺性状遗传多样性分析

《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】分析广西豌豆地方种质资源农艺性状的遗传多样性并筛选优异种质,为其高效利用提供参考依据。【方法】以71份广西豌豆地方种质资源为材料,测定其农艺性状(10个质量性状和16个数量性状),分析其遗传变异情况,并进行相关性分析、主成分分析和聚类分析。【结果】10个质量性状的变异系数变化范围为13.07%~47.71%,平均29.16%,所有质量性状变异系数均大于10.00%;遗传多样性指数变化范围为0.13~1.26,平均值为0.62。16个数量性状变异系数变化范围为5.78%~61.75%,平均24.07%,多数性状变异系数大于10.00%;遗传多样性指数变化范围为1.73~2.07,平均1.93。相关性分析结果表明,在26个农艺性状中,大部分性状间存在不同程度的相关性。主成分分析表明,26个农艺性状前7个主成分的累计贡献率为75.621%,主要与生育期、产量、籽粒外观、株型、荚果外观有关。聚类分析结果表明,71份广西豌豆地方种质资源主要分为2个类群(I类群和Ⅱ类群),其中I类群又分为2个次级类群(Ia和Ib类群),Ia类群属于高秆、蔓生、迟熟、较高产、较抗白粉病的材料,Ib类群属于荚较多且较大,产量较高,籽粒较小,较感白粉病的材料,Ⅱ类群属于较早熟,矮秆,直立,长荚,产量较低,较感白粉病的材料。筛选出14份具有优异农艺性状的豌豆种质资源,其中,2、40、61和67号高产、抗白粉病、综合性状较优异的种质可直接推广应用;3、5、14、15、41、57、59、66、68和71号具有某个(些)优异农艺性状的种质可作为后续创制豌豆优良新种质的亲本。【结论】71份广西豌豆地方种质资源农艺性状遗传多样性较丰富,具有分枝多、节数多、果荚较长、籽粒较多且大的特点。

关键词: 豌豆 地方种质资源 遗传多样性 主成分分析 聚类分析 广西

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金顶侧耳种质资源遗传多样性分析及耐高温种质筛选

《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】分析金顶侧耳种质ISSR分子标记及农艺性状的遗传多样性,为广西地区耐高温品种选育及遗传改良提供参考。【方法】以29株金顶侧耳菌株为材料,对其进行ISSR分子标记检测、表型性状测定和耐热性鉴定,分析其遗传多样性,并对其进行聚类分析、相关分析和主成分分析,筛选出商品性佳、耐高温的种质。【结果】利用筛选出的16个ISSR引物对29株金顶侧耳菌株进行聚类分析,结果显示,供试菌株间遗传相似系数为0.67~0.96,在遗传相似系数为0.79时,可分为14个类群,其中广西地区种质分布9个类群,包括3个野生种质类群,说明金顶侧耳种质遗传差异较大,遗传背景丰富。去除未出菇和表型性状相同的菌株,其余26株金顶侧耳菌株表型性状的Shannon-wiener多样性指数(H')为0.516~2.010,其中菌盖横径的H'最高,菌棒成活率的H'最小;基于数量性状将其分成七大类群,其中广西地区种质分布六大类群,其中第Ⅰ类群种质每丛子实体数量较多、较小,可用作观赏;第Ⅱ类群为广西区外品种,每丛子实体数量多,第1潮菇产量高,可用作子实体数量和首潮菇产量的改良;第Ⅲ类群为广西栽培菌株,每丛子实体数量少,可用作子实体数量的改良;第Ⅳ类群为广西栽培品种,菌盖大,可用作菌盖大小改良;第Ⅴ类群菌盖颜色深、菌盖横径与菌柄长度的比值高,可用于菌盖颜色和菇形改良;第Ⅵ类群为广西主推品种,早熟且综合农艺性状优良,可用作早熟和商品性状改良的亲本材料;第Ⅶ类群为广西野生种质,幼菇菌盖鳞片颜色深,产量高,可用于鳞片颜色及高产改良。22个表型性状中,呈极显著(P<0.01,下同)相关的性状有28对,呈显著(P<0.05)相关的性状有21对,其中第1潮菇产量与每丛子实体数量、菌柄长度与菌盖横径与菌柄长度的比值分别呈极显著正或负相关(|r|>0.800),成熟时间与总产量呈极显著负相关(r=-0.636)。7个主成分对表型变异的累计方差贡献率达83.117%。菌株耐热性试验鉴定结果显示,26株亲缘关系明晰且正常出菇的菌株分为耐热型9株、中间型12株、不耐热型5株,各类型材料在广西地区均有分布。【结论】广西金顶侧耳种质资源具有丰富的遗传多样性,育种潜力巨大,可将子实体数量作为首潮产量性状进行改良,成熟时间作为总产量性状进行改良,菌柄长度作为菌盖横径与菌柄长度的比值性状进行筛选。

关键词: 金顶侧耳 ISSR标记 表型性状 遗传多样性 聚类分析 主成分分析 耐热性鉴定

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新菠萝灰粉蚧取食对四种寄主植物挥发物组成的影响

《昆虫学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】探明外来入侵害虫新菠萝灰粉蚧Dysmicoccus neobrevipes取食对寄主植物挥发物组成的影响,分析挥发物介导的新菠萝灰粉蚧为害寄主植物行为机制,为选育寄主抗虫品种以及研发新菠萝灰粉蚧及其天敌昆虫调节剂提供参考。【方法】采用动态顶空吸附法(dynamic headspace adsorption, DHSA)收集新菠萝灰粉蚧成虫取食为害不同时间时(0, 1, 2, 4和8 d)剑麻、菠萝、香蕉和南瓜4种寄主植物释放的挥发物,通过气相色谱-质谱联用仪(gas chromatography-mass spectrometry, GC-MS)鉴定并分析出新菠萝灰粉蚧成虫取食前后不同寄主植物挥发物组分的异同和含量的变化。同时,利用Y形嗅觉仪进一步研究新菠萝灰粉蚧成虫对9种单一化合物的趋向行为反应。【结果】剑麻健康株挥发物组分有4类共9种化合物,新菠萝灰粉蚧成虫取食为害(虫害)剑麻植株挥发物组分有5类12种;菠萝健康株挥发物组分有4类8种,菠萝虫害株挥发物组分有5类11种;南瓜健康株获得的6类组分均存在于南瓜虫害株中;香蕉健康株挥发物组分有5类11种,香蕉虫害株挥发物组分有7类15种。剑麻和菠萝的健康株和虫害株中,酮类物质相对含量最高;南瓜的健康株和虫害株中,醚类物质相对含量最高;香蕉的健康株和虫害株中,烷烃类物质相对含量最高。4, 6-二甲基十二烷和萘分别是剑麻独有的挥发性有机化合物(volatile organic compounds, VOCs)和菠萝特有的昆虫取食为害的植物挥发物(herbivore-induced plant volatiles, HIPVs)。与健康植株释放的挥发性化合物相比,受新菠萝灰粉蚧成虫取食为害的寄主挥发物中新出现了3-己酮、 2-己酮、(+)-柠檬烯、 3-蒈烯、 4-(1-羟乙基)苯甲醛、 2-异丙基-5-甲基茴香醚、萘、对乙基苯乙酮和柏木脑9种VOCs,表明这些化合物是寄主挥发物-新菠萝灰粉蚧-天敌昆虫之间互相影响的主要因子。其中4-(1-羟乙基)苯甲醛、对乙基苯乙酮和柏木脑可以有效吸引新菠萝灰粉蚧成虫,(+)-柠檬烯、 3-蒈烯、 2-异丙基-5-甲基茴香醚和萘等化合物则对新菠萝灰粉蚧成虫具有驱避作用。【结论】9种新增HIPVs的发现为新菠萝灰粉蚧驱避剂及其天敌昆虫引诱剂研制以及利用昆虫调节剂控制该虫提供了理论基础。

关键词: 新菠萝灰粉蚧 寄主植物 挥发物 趋向行为反应 聚类分析

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