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资源类型: 中文期刊
关键词:聚类分析(模糊匹配)
共112条记录
10份番木瓜种质的主要性状表现及主成分分析、聚类分析

《中国南方果树 》 2021 北大核心

摘要:为了观察不同番木瓜种质在广西的表现,记录了10份番木瓜种质的植物学性状、农艺性状、品质性状、抗花叶病性状,并进行主成分分析、相关性分析、聚类分析。结果表明,10份种质表现出不同程度的差异,主要表现在株产与单果质量。主成分分析显示,10份番木瓜种质的15个数量性状可划分为4个主成分,累计贡献率达80.74%;相关性分析显示,10份番木瓜种质的15个数量性状间表现出不同程度的正相关性,说明所选指标间的影响密切。其中株产与两性瓜单果质量、叶长、花序长度,两性瓜单果质量与叶长、叶宽、花序长度、每节位花量等存在极显著正相关。聚类分析在平方欧氏距离5的临界点可将10份种质分为2类,即大果型和小果型,分类特征主要表现在两性瓜单果质量和株产。

关键词: 番木瓜 种质 主成分分析 相关性分析 聚类分析

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基于文献计量法的国内木薯研究现状分析

《农业研究与应用 》 2020

摘要:本文以2000-2020年中国知网数据库中关于木薯研究的期刊文献作为数据来源,从文献计量分析法的角度采用Excel及CiteSpace软件统计、绘制可视化图谱,分析文献数量与时间的变化关系及核心期刊数据库中载文期刊、核心作者群及机构、研究热点、前沿动态等.结果表明:木薯研究文献数量呈波动上升后趋向平稳,后略有下降;研究基础成熟,核心数据库中已形成了较为固定的研究团队;关键词聚类分析发现,木薯淀粉研究热点最高,加工方面的研究最为热门;前沿分析发现今年木薯研究突变词较少,"表达分析"、"基因克隆"等具有较大的发展潜力.综上结果,木薯研究已成为较成熟的领域,未来木薯研究人员应加强团队合作,扩宽研究领域,积极开发新热点,进一步推动木薯产业的发展.

关键词: 木薯 文献计量法 CiteSpace 聚类分析

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基于因子分析和聚类分析的30份山黄皮种质资源评价

《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要:选取单果重、果实纵径、果实横径、果形指数、单种重、种子纵径、种子横径、可食率、可溶性固形物含量9个性状指标对30份山黄皮种质资源进行评价.结果表明,山黄皮果实的单果重变异幅度最大,果形指数的变异幅度最小;除可溶性固形物含量与其他8个性状相关性不显著外,其余各指标之间大都存在显著或极显著的相关性;采用因子分析和聚类分析将30份山黄皮种质聚为3大类,山黄皮种质资源的果实性状与地理起源有一定的相关性.其中,来自广西龙州县和宁明县的13份山黄皮种质的果实性状表现最好.

关键词: 山黄皮 种质资源 果实性状 因子分析 聚类分析

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杧果品种亲缘关系的CDDP分析

《浙江农业学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要:利用保守DNA衍生多态性(CDDP)分子标记技术,对广西亚热带作物研究所保存的31个杧果品种进行遗传多样性分析,为杧果种质资源的鉴定及分子辅助育种提供理论依据.筛选出8条CDDP引物对供试的杧果品种进行PCR扩增,分析电泳图,并进行聚类分析和主成分分析.从31个杧果品种中共扩增出107条清晰条带,其中多态性条带(NPB)100条,多态性比率(PPB)达到93.57%.平均每条引物可扩增出13条带和12条多态性带.每个位点的平均等位基因数(N_a)、有效等位基因数(N_e)、Nei's基因多样性(H)、Shannon信息指数(I)分别为1.847 1、1.636 8、0.410 8、0.84,表明杧果品种间具有丰富的遗传多样性.供试杧果品种间相似性系数范围为0.620 6~0.920 8.UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数0.690 6处可以将供试杧果划分为7类,主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,划分结果与杧果来源地无密切关系.筛选获得的CDDP引物对杧果种质资源有较高的多态性检测率,适用于资源鉴别及亲缘关系分析.

关键词: 杧果 CDDP 聚类分析 主成分分析

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基于因子分析和聚类分析的广西农垦农场综合发展水平评价-以广西农垦24个农场为例

《安徽农业科学 》 2020

摘要:以广西农垦24个农场为样本,选取第一产业生产总值、第二产业生产总值、第三产业生产总值、地区生产总值等16项指标,利用广西农垦统计年报相关数据,构建综合发展水平评价体系,先采用因子分析的方法,对各农场的综合发展水平进行排序,在此基础上采用系统聚类法Ward法,通过因子综合得分对各地区进行聚类,分成4类.并针对不同的类型对各类别做简要分析,根据社会发展形势、国家政策和地区特点提出建议.

关键词: 因子分析 聚类分析 综合发展水平 评价

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25份素馨属种质资源的表型性状遗传多样性研究

《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要:对25份观赏型素馨属(Jasminum Linn.)种质资源的21个表型性状进行多样性和亲缘关系研究.结果 表明:不同质量性状在群体中出现的频率不同,9个质量性状的变异范围为26.92%~59.54%,12个数量性状的变异范围为23.81%~88.08%,表明供试种质各表型性状间存在较大程度的变异;对实验材料的花部和叶部性状进行主成分分析发现,12个花部性状归于4个主成分中,9个叶部性状归于3个主成分中.根据表型性状各主成分进行聚类分析,供试25份种质被聚为3大类群,花苞直径、百花重等性状是表型聚类的依据.通过对花部和叶部性状的综合分析,筛选出综合特性最好,观赏价值最高的9号虎头茉莉,园林观赏应用潜力最佳.

关键词: 素馨属 表型性状 主成分分析 聚类分析

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广西原产和引种荔枝种质资源的遗传多样性 分析及核心种质构建

《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要:[目的]利用SSR分子标记对广西荔枝种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质,为广西荔枝种质资源的保存、遗传改良及创新利用提供理论依据.[方法]以广西原产和引种的88份荔枝种质资源为研究对象,利用40对SSR引物对其进行遗传多样性和聚类分析,在此基础上按原始群体50.00%、25.00%和12.50%的取样比例,采用逐步聚类法优先选择性状优良材料的原则构建广西荔枝核心种质.[结果]40对SSR引物从88份荔枝种质资源中共扩增出282条清晰的条带,每对引物扩增条带数2~13条,平均7.05条,其中,多态性条带182条,每对引物扩增的多态性条带数1~13条,平均4.55条,每对引物扩增条带的多态性比率为14.29%~100.00%,平均64.54%.88份荔枝种质资源的遗传相似系数为0.83~0.96,说明其遗传多样性较低;在遗传相似系数0.86处,88份荔枝种质资源可分为七大类群,第Ⅰ~Ⅶ类群分别包含3、12、6、6、1、2和58份种质,其中第Ⅰ类群均为龙荔种质资源,第Ⅱ类群主要为早熟种质,第Ⅳ类群主要为早熟实生种质,表明荔枝种质间的亲缘关系与熟期存在一定的相关性.88份荔枝种质资源在40个SSR位点的平均观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon指数(I)和期望杂合度(He)分别为3.2750、2.1137、0.8092和0.5107.核心种质-1、核心种质-2和核心种质-3的种质资源数量分别为44、22和11份,其中,核心种质-2的Ne、I和He 3个遗传多样性参数均最高,分别为2.1774、0.8452和0.5271;仅核心种质-3的Na与原始群体存在极显著差异(P<0.01),3组核心种质的其余遗传多样性参数与原始群体无显著差异(P>0.05),表明核心种质-1和核心种质-2均能充分代表原始群体的遗传多样性,根据核心种质构建的原则,最终选择核心种质-2作为广西荔枝核心种质.[结论]SSR分子标记是一种适用于荔枝资源遗传多样性分析和核心种质构建的理想分子标记.广西荔枝种质资源遗传背景相对较窄,遗传多样性较低,今后应加强荔枝种质资源的引进与利用.

关键词: 荔枝 SSR分子标记 遗传多样性 遗传相似系数 核心种质 聚类分析

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菜心和芥蓝表型多样性的主成分分析与聚类分析

《西南农业学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要:【目的】综合评价26份菜心和7份芥蓝资源的表型多样性,为挖掘和利用优异蔬菜种质资源提供参考依据。【方法】测定26份菜心资源和7份芥蓝资源的16个表型性状,利用主成分分析和聚类分析法进行分析评价。【结果】菜心和芥蓝均具有较大的表型性状变异,且变异来源不同,菜心的变异主要源于叶重、主薹重、单株重、开展度、主薹直径、薹色和叶色等质量性状和横向性状,芥蓝的变异主要源于株高、主薹茎长和叶片数等纵向性状。初花期可能是菜心和芥蓝花期性状变异的主要来源;菜心和芥蓝的抗虫性变异均大于抗病性,菜心的抗病性和抗虫性变异均大于芥蓝。相关性分析结果表明,菜心性状间的相关性比芥蓝简单,二者的花期、株高、主薹茎长、主薹直径、主薹重和单株重等相关性变化一致,而开展度、叶片数、叶重、叶色、薹色、抗病性和抗虫性等性状差异较明显。主成分分析结果表明,菜心16个表型性状的绝大部分信息由4个累计贡献率达81.76%的花期因子、主薹因子、颜色因子和叶片因子表示,芥蓝16个表型性状的绝大部分信息由3个累计贡献率达91.38%的花期因子、主薹因子和叶片因子表示。综合评价结果表明,菜心4号、12号、20号和25号及芥蓝5号、6号和7号性状优异。聚类分析结果表明,26份菜心资源可分为三大类,7份芥蓝资源可分为两大类,均与主成分分析及综合评价结果一致。【结论】菜心和芥蓝资源表型多样性的主成分分析与聚类分析结果一致性较佳,其中主成分分析可简化表达表型性状及其相互关系,用以评价原始性状更简单直观,用于种质资源评价可提高准确度。

关键词: 菜心 芥蓝 主成分分析 聚类分析

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黑穗病菌1号生理小种致病力及甘蔗杂交材料的抗性评价

《广西糖业 》 2020

摘要:通过比较黑穗病菌1号生理小种与混合孢子粉的致病性,并评价103份甘蔗材料对黑穗病菌1号生理小种的抗性,为甘蔗黑穗病菌生理小种的深入研究及甘蔗优良抗病品种的选育提供科学依据.结果表明,在致病力测试的10份材料中,黑穗病菌1号生理小种对4份材料的致病力较混合孢子粉降低,抗性等级提高1~2级,对2份材料的致病力提高,抗性等级均下降2级,两种接种体对其余4份材料的致病性均表现完全一致.抗性评价的103份甘蔗材料中,43份不发病,60份材料的发病率为1.32%~30.06%,其中感病4份,中感10份,中抗5份,抗27份,高抗14份.发病率最高的是桂糖11-80,平均发病率为30.06%,重复最高发病率为44.74%.引起桂糖42号和LC05-136黑穗病的病原可能是2号小种.部分材料对黑穗病的抗性产生不同程度分化.黑穗病潜伏期为57~146d,发病率较高(10%以上)的甘蔗材料黑穗病潜伏期主要集中在57~93d.对黑穗病发病率与潜伏期的相关性进行分析表明,潜伏期越长,甘蔗材料对黑穗病菌的抗性越好.统聚类分析的结果与参试甘蔗品种的抗性表现一致.

关键词: 甘蔗黑穗病 生理小种 潜伏期 抗性评价 聚类分析

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基于SCoT分子标记的48份杨桃种质遗传多样性分析

《南方农业学报 》 2019 北大核心 CSCD

摘要:[目的]分析48份杨桃种质的遗传多样性,为杨桃种质资源的鉴定保护及开发利用提供理论依据.[方法]从60条SCoT引物中筛选出扩增条带清晰稳定、多态性丰富的引物,对从国内外收集的48份杨桃种质材料进行PCR扩增,统计分析电泳图谱,利用Popgene 1.32计算其遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数和遗传距离,利用UPGMA法进行聚类分析,并根据遗传相似系数进行主成分分析.[结果]从60条SCoT引物中筛选出的11条引物共扩增出115条条带,其中多态性条带102条,占总条带数的88.7%,每条SCoT引物扩增的总条带数(TNB)和多态性条带数(NPB)分别为10.45和9.27条,多态性比率(PPB)为70.00%~100.00%,平均为88.84%;多态性信息量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)的平均值分别为0.77、1.7758、0.4229和0.6061.48份杨桃种质间的遗传相似系数为0.4957~0.9217,平均为0.6841.聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.6618处可将48份杨桃种质划分为三大类群,第Ⅰ类群均为甜杨桃种质,第Ⅱ类群以酸杨桃种质为主,第Ⅲ类群以甜杨桃种质为主.主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,均与杨桃的果实风味和种质来源高度相关.[结论]杨桃种质资源具有较丰富的遗传多样性,且筛选获得的SCoT引物对杨桃种质资源有较高的多态性检测率,适用于杨桃种质资源鉴别及亲缘关系分析.

关键词: 杨桃 遗传多样性 SCoT标记 聚类分析 主成分分析

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