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葡萄PRC1-like核心组分基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 丰景 1 ; 卢江 1 ;

作者机构： 1.广西农业科学院

关键词： 葡萄;PRC1;基因克隆;序列分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2019 年 008 期

页码： 3637-3645

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 克隆葡萄PRC1-like核心组分基因并预测其功能.在NCBI中分别查找与拟南芥PRC1核心组分基因同源性最高的葡萄序列,采用CTAB法提取葡萄品种'赤霞珠'(Cabernet sauvignon)嫩叶中总RNA,运用RT-PCR技术进行克隆,得到葡萄PRC1-like核心组分基因的CDS序列,并通过各种在线软件对葡萄PRC1-like核心组分基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析.获得4个葡萄PRC1-like核心基因,这些基因CDS全长分别为1 614 bp、1 362 bp、1 293 bp和1 275 bp,分别编码568个、453个、430个和424个氨基酸,预测其蛋白质的相对分子量分别为64.17 kD、50.69 kD、47.99 kD和47.71 kD,推测这些蛋白均为亲水性不稳定蛋白,与已知拟南芥PRC1相应的核心蛋白具有高度的同源性,亚细胞定位预测结果表明这些蛋白主要存在于细胞核中.推测葡萄PRC1-like在葡萄发育中起着重要作用,这为进一步阐明葡萄PRC1-like的功能及作用机制提供了理论依据.

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