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香蕉磷脂酶C基因生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 殷菲胧 1 ; 廖玲燕 1 ; 刘云芬 1 ; 孙健 2 ; 郑培君 3 ; 李丽 2 ; 帅良 1 ;

作者机构: 1.贺州学院食品与生物工程学院

2.广西壮族自治区农业科学院农产品加工研究所

3.佛山职业技术学院新能源与节能环保工程学院

关键词: 香蕉;磷脂酶C;生物信息学;基因表达

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2024 年 22 卷 022 期

页码: 7309-7318

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究香蕉磷脂酶C (phospholipase C, PLC)基因的功能,本研究通过blastp结合结构域筛选的方法,从香蕉基因组搜索鉴定出5个磷脂酶C基因,分别命名为MaPI-PLC2、MaPI-PLC6、MaNPC1、MaNPC2和MaNPC6,并对其进行了生物信息学和组织特异性表达分析。生物信息学分析表明,5个香蕉PLC蛋白氨基酸数在515~593之间,等电点在5.72~8.96之间;5个香蕉PLC蛋白均为不稳定的亲水性蛋白;跨膜结构分析发现,只有MaNPC1有跨膜结构,其他4个香蕉PLC蛋白均无跨膜结构;信号肽预测发现,所有的MaNPC均有信号肽,所有的MaPI-PLC均无信号肽。香蕉果实PLC基因不同组织特异性表达分析结果显示,MaPI-PLC-2、MaNPC-2和MaPI-PLC-6基因均在芽、嫩叶和根中有较高表达,MaNPC6在未成熟的果皮和果肉中高度表达,MaNPC1则在成熟的组织(果皮,果肉,老叶)表达含量远高于未成熟组织(果皮,果肉,芽,嫩叶),表明香蕉磷脂酶C全程参与了香蕉发育、成熟和衰老。本研究可为后期香蕉磷脂酶C功能研究奠定基础。

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