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甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析

文献类型: 会议论文

第一作者: Niu Junqi

作者: Niu Junqi 1 ; 牛俊奇 1 ; Wu Chaoxing 1 ; 吴朝兴 2 ; Yang Litao 3 ;

作者机构: 1.广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530005

2.中国农业科学院甘蔗研究中心 广西农业科学院甘 蔗研究所 农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 广西甘蔗遗传改良重点实验室 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁 530007

3.广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530

关键词: 甘蔗;SoNIN1基因;转化酶;生物信息学

会议名称: 广西甘蔗学会第十届代表大会暨2015年学术交流会

主办单位: 广西甘蔗学会

页码: 00000001-00000152

摘要: 根据前期克隆得到的SoNIN1基因的全长cDNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片gDNA中克隆SoNIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构.结果表明,SoNIN1基因的DNA序列长4938bp,包含6个外显子和5个内含子,GenBank登录号KF563902.在该基因5'非翻译区存在一个268bp内含子序列,同时5个内含子序列中含有与低温、干旱和激素等胁迫响应相关的作用元件,这些可能对SoNIN1基因转录表达起调控作用.依据SoNIN1蛋白聚类和外显子-内含子基因结构可以将植物NINs分为两类.

分类号: S566.101

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