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资源类型: 中文期刊
关键词:指纹图谱(模糊匹配)
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基于ISSR与SCoT分子标记的赤苍藤种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

分子植物育种 2023 北大核心 CSCD

摘要:为了选育赤苍藤优良品种,本研究利用ISSR与SCoT分子标记技术对24份赤苍藤种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,11条ISSR引物共扩增出91个条带,其中多态性带条73个,平均每条引物扩增多态性条带6.6个;10条SCoT引物共扩增出102个条带,其中多态性条带86个,平均每条引物扩增多态性条带8.6个。基于ISSR与SCoT标记的遗传相似系数的范围分别是0.560 4~0.857 1和0.529 4~0.882 4,说明赤苍藤种内具有较为丰富的遗传变异,其遗传多样性的表现与地理位置的相关性不显著。ISSR与SCoT标记分别在遗传相似系数0.72和0.69处可将24份赤苍藤种质聚为3类,两种分子标记的聚类结果基本相同。此外,在此研究基础上通过2条ISSR引物组合(UBC824, UBC827)和2条SCoT引物组合(SCoT-2, SCoT-27)分别构建了赤苍藤种质的DNA指纹图谱。本研究为赤苍藤种质资源的保护与利用、品种的鉴定与分类、选育与改良提供了理论依据。

关键词: 赤苍藤 ISSR SCoT 遗传多样性 指纹图谱

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晾晒烟种质资源ISSR指纹图谱构建及遗传变异分析

福建农业学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:【目的】较为准确地揭示晾晒烟种质间的遗传关系,提高晾晒烟种质资源的利用率和育种效率。【方法】利用ISSR分子标记技术对36份晾晒烟种质资源进行遗传多样性分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出7条多态性好的引物,扩增出113个条带,其中91条多态性条带,多态性条带比例有80.5%;ISSR标记有效等位基因数(Ne)的平均值为1.64,Nei′s基因多样性指数(H)的平均值为0.37,Shannon′s信息指数(I)值的平均值为0.55,表明ISSR标记具有较高的多态性检测效率;聚类分析结果表明36份晾晒烟种质间的遗传相似性系数(GS)为0.74~0.91,品种间遗传多样性水平较低,以0.78处作为截值可以划分为5个组;数字指纹图谱可以较为有效地将供试材料进行区分。【结论】ISSR标记适合用于构建晾晒烟的DNA指纹图谱,可以为晾晒烟的品种鉴定提供科学依据。

关键词: 晾晒烟 ISSR 指纹图谱 遗传多样性

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广西香蕉种质资源的SSR分析

西南农业学报 2016 北大核心 CSCD

摘要:研究广西特色香蕉种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为香蕉种质资源分类、品种鉴定和有效利用提供理论参考。采用13对SSR荧光标记引物,对收集到的24份广西主栽香蕉品种及特色种质资源进行扩增,采用毛细管电泳对其进行基因分型。共扩增得到131个等位基因,平均每对引物扩增得到10.1个等位基因。引物的多态性信息含量(PIC)为0.65~0.87,平均0.77。在相似系数0.85附近,24个香蕉品种划分为4个大类:第一大类包含栽培种的香牙蕉和广西各地区的野生近缘种,第二大类为大蕉,第三大类为粉蕉,第四大类为贡蕉。从收集到的野生资源中筛选与栽培种亲缘关系较近、且具有良好抗病性的品种,可作为抗病育种的中间材料,并从分子角度入手挖掘优良的基因加以应用。

关键词: 香蕉 SSR标记 指纹图谱 广西

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广西铁皮石斛HPLC指纹图谱研究

天然产物研究与开发 2012 CSCD

摘要:采用HPLC法建立广西铁皮石斛提取液的指纹图谱,运用相似度评价药材质量。结果表明,在13个共有峰构成的铁皮石斛指纹图谱中,有11批药材相似度均在0.8以上,2批的相似度较差,未达到0.8,表明相似度大小与药材的产地有关。通过对栽培铁皮石斛不同部位药材的指纹图谱峰面积的比较,不提倡对药材提早采收。3批组织培养铁皮石斛的图谱相似度较低,说明培养到不同阶段的铁皮石斛材料组织培养物,其化学成分相差较大。

关键词: 铁皮石斛 HPLC 指纹图谱

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甘蔗属不同种及优良甘蔗栽培品种的SSR标记遗传多样性分析

广西植物 2010 北大核心 CSCD

摘要:应用21对SSR引物与毛细管电泳技术,分析了52个甘蔗属品种的遗传多样性。共检测出327个SSR标记,平均每对引物检测15.6个。选择141个共显性标记构建SSR标记指纹图谱数据库,利用DNAMAN软件与UPGMA统计方法分析参试材料遗传多样性。DNAMAN软件同源分析显示,新台糖16号与台优1号之间的同源性最高(87%),品种之间最小的同源性为55%;利用UPGMA统计方法可把参试材料分成4个遗传相似性较高的类群。结果表明,SSR标记与毛细管技术的结合,可构建甘蔗种质资源SSR标记指纹图谱、分析甘蔗种质资源遗传多样性。聚类分析显示参试甘蔗材料的遗传基础相近,为了提高甘蔗选育种效率,应拓宽甘蔗选育种亲本的遗传基础,提高杂交栽培品种的抗虫、抗病等特性。

关键词: 简单重复序列(SSR) 甘蔗属 指纹图谱 毛细管电泳 遗传多样性

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甘蔗(Saccharum officinarum L.)品种遗传差异的AFLP分子标记分析

作物学报 2004 北大核心 CSCD

摘要:采用AFLP技术 ,从 6 4对引物中筛选出 5对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物 ,对两个在生产上广泛推广应用的甘蔗品种的AFLP指纹图谱进行分析 ,计算了两品种间的遗传相似性和遗传距离。结果表明 ,5对引物在 2个甘蔗品种间均存在显著的差异 ,其中多态性位点占总扩增位点的 10 2 % ,区分率达 10 0 %。这对应用AFLP技术鉴定甘蔗品种的真伪提供了依据。本文还对甘蔗AFLP分析体系的关键技术以及银染的安全性和可靠性进行了讨论。

关键词: 甘蔗(Saccharum officinarum L.) AFLP 指纹图谱 品种鉴定

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用AFLP分子标记技术鉴别甘蔗(Saccharum of ficinarum L.)品种

分子植物育种 2003 CSCD

摘要:本研究采用AFLP技术 ,从 6 4对引物中筛选出 5对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物 ,对两个在生产上广泛推广应用的甘蔗品种的AFLP指纹图谱进行分析 ,计算了两品种间的遗传相似性和遗传距离。结果表明 ,5对引物在 2个甘蔗品种间均存在显著的差异 ,其中多态性位点占总扩增位点的 10 2 % ,区分率达 10 0 %。研究结果对生产上应用AFLP技术鉴定甘蔗品种的真伪性提供了依据。本文对甘蔗AFLP分析体系的关键技术以及银染技术的安全性和可靠性进行了讨论。

关键词: 甘蔗(Saccharum of ficinarum L.) AFLP 指纹图谱 品种鉴定

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